More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1204 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 381 aa  765    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  48.01 
 
 		 380 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  44.68 
 
 		 381 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  47.89 
 
 		 380 aa  342  5e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  46.48 
 
 		 383 aa  341  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  47.88 
 
 		 380 aa  339  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  45.99 
 
 		 385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  46.93 
 
 		 381 aa  334  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  44.3 
 
 		 382 aa  334  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  44.12 
 
 		 380 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  44.95 
 
 		 382 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  46.19 
 
 		 385 aa  318  7e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  45.12 
 
 		 381 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  44.3 
 
 		 400 aa  312  7.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  41.91 
 
 		 388 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  45.77 
 
 		 380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  44.12 
 
 		 383 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  41.62 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  42.59 
 
 		 380 aa  293  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  40.96 
 
 		 385 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  38.52 
 
 		 386 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  38.26 
 
 		 386 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  45.07 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  38.87 
 
 		 378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  39.31 
 
 		 380 aa  280  2e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  41.84 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  40.16 
 
 		 384 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  41.11 
 
 		 381 aa  280  4e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  43.14 
 
 		 413 aa  273  5.000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  38.73 
 
 		 379 aa  270  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  36.75 
 
 		 398 aa  247  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  37.17 
 
 		 388 aa  244  3e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  32.8 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  35.54 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  35.82 
 
 		 392 aa  237  3e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  35.37 
 
 		 380 aa  236  4e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  33.25 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  39.89 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  36.17 
 
 		 376 aa  222  9e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  36.34 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  35.79 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  35.6 
 
 		 405 aa  215  9e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  35.34 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  34.39 
 
 		 386 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  36.48 
 
 		 420 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  38.06 
 
 		 878 aa  211  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  37.47 
 
 		 880 aa  206  5e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.27 
 
 		 885 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  32.63 
 
 		 376 aa  203  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.85 
 
 		 644 aa  202  9e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  33.77 
 
 		 879 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  36.18 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  34.03 
 
 		 393 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  33.33 
 
 		 434 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  35.43 
 
 		 896 aa  196  6e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.33 
 
 		 417 aa  196  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.24 
 
 		 429 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.24 
 
 		 429 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  34.29 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.55 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.26 
 
 		 641 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  35.51 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  33.77 
 
 		 414 aa  193  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  33.94 
 
 		 626 aa  192  9e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.11 
 
 		 418 aa  192  9e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  36.62 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  35.66 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  29.87 
 
 		 378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.67 
 
 		 630 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  32.37 
 
 		 393 aa  190  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  33.59 
 
 		 421 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.29 
 
 		 413 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.55 
 
 		 413 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  29.61 
 
 		 417 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  34.91 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  29.92 
 
 		 425 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.71 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.19 
 
 		 429 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  31.71 
 
 		 688 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.33 
 
 		 560 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.2 
 
 		 406 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  32.45 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.55 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  32.46 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  29.62 
 
 		 416 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.04 
 
 		 413 aa  186  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  29.37 
 
 		 416 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.51 
 
 		 408 aa  186  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  31.38 
 
 		 420 aa  185  9e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  32.46 
 
 		 410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  35.61 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.91 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  34.01 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.38 
 
 		 419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.28 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.48 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.01 
 
 		 427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.12 
 
 		 414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.25 
 
 		 429 aa  183  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.43 
 
 		 415 aa  182  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>