More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2241 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  99.41 
 
 		 506 aa  1036    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  99.21 
 
 		 506 aa  1033    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  100 
 
 		 506 aa  1042    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  99.21 
 
 		 513 aa  1034    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  99.01 
 
 		 506 aa  1033    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  50.1 
 
 		 507 aa  525  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  52.18 
 
 		 501 aa  521  1e-146  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  49.6 
 
 		 494 aa  508  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  50.99 
 
 		 515 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  46.73 
 
 		 513 aa  477  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  48.53 
 
 		 514 aa  473  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  49.9 
 
 		 772 aa  463  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  51.07 
 
 		 508 aa  459  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  47.92 
 
 		 517 aa  459  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  49.21 
 
 		 776 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  49.02 
 
 		 787 aa  451  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  47.54 
 
 		 514 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  48.92 
 
 		 797 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  48.73 
 
 		 532 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  45.45 
 
 		 506 aa  434  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  44.58 
 
 		 503 aa  435  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  45.34 
 
 		 487 aa  433  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  45.86 
 
 		 487 aa  434  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  47.52 
 
 		 864 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  46.47 
 
 		 514 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  45.36 
 
 		 503 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  45.96 
 
 		 494 aa  426  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  46.49 
 
 		 484 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  49.3 
 
 		 486 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  49.5 
 
 		 504 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  47.15 
 
 		 551 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  47.39 
 
 		 777 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  44.99 
 
 		 503 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  46.69 
 
 		 485 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  47.23 
 
 		 512 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  50 
 
 		 484 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  47 
 
 		 483 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  44.57 
 
 		 529 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  46.07 
 
 		 539 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  46.68 
 
 		 509 aa  415  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  49.8 
 
 		 535 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  46.41 
 
 		 487 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  45.79 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  48.72 
 
 		 501 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  46.02 
 
 		 852 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  49.4 
 
 		 512 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  45.7 
 
 		 521 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  49.6 
 
 		 585 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  49.4 
 
 		 545 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  47.18 
 
 		 518 aa  412  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  45.51 
 
 		 863 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  49.4 
 
 		 529 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  45.42 
 
 		 500 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  49.4 
 
 		 531 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  49.4 
 
 		 523 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  44.58 
 
 		 490 aa  411  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  47.41 
 
 		 495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  45.58 
 
 		 475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  44.95 
 
 		 503 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  45.19 
 
 		 863 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  45.44 
 
 		 511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  45.91 
 
 		 490 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  46.84 
 
 		 498 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  45.89 
 
 		 481 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  45.49 
 
 		 487 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  48.71 
 
 		 520 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  46.31 
 
 		 534 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  46.33 
 
 		 485 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  45.71 
 
 		 490 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4863  cobyric acid synthase  45.17 
 
 		 508 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00498054  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  44.68 
 
 		 512 aa  396  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  46.99 
 
 		 495 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  44.51 
 
 		 493 aa  395  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  44.96 
 
 		 485 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  44.97 
 
 		 509 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  43.51 
 
 		 489 aa  395  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  45.42 
 
 		 496 aa  395  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  48.3 
 
 		 500 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  44.98 
 
 		 575 aa  395  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  44.51 
 
 		 858 aa  395  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  43.09 
 
 		 495 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  47.5 
 
 		 511 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2912  cobyric acid synthase  46.15 
 
 		 478 aa  395  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.698516 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2451  cobyric acid synthase  47.92 
 
 		 504 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0760496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  44.75 
 
 		 495 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  48.71 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  44.66 
 
 		 534 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  44.77 
 
 		 486 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  44.6 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  47.7 
 
 		 511 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  45.55 
 
 		 484 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  42.28 
 
 		 488 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  47.7 
 
 		 511 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  45.02 
 
 		 509 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0665  cobyric acid synthase  45.82 
 
 		 488 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  44.06 
 
 		 560 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  45.17 
 
 		 495 aa  388  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  42.61 
 
 		 541 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  42.8 
 
 		 541 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  45.69 
 
 		 510 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>