161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2167 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2167  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  25.7 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  28.77 
 
 		 371 aa  95.9  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  24.66 
 
 		 354 aa  96.3  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  28.12 
 
 		 351 aa  95.5  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  30.56 
 
 		 350 aa  93.6  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  28.67 
 
 		 338 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  26.96 
 
 		 384 aa  90.5  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  28 
 
 		 346 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  26.79 
 
 		 350 aa  89.4  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  23.32 
 
 		 362 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  26.82 
 
 		 341 aa  87.8  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  26.92 
 
 		 368 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  26.11 
 
 		 352 aa  87.8  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  28.63 
 
 		 330 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  25.79 
 
 		 356 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  25.79 
 
 		 356 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  29.22 
 
 		 350 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  32.61 
 
 		 341 aa  86.7  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  27.88 
 
 		 350 aa  85.9  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  27.88 
 
 		 350 aa  85.9  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  27.56 
 
 		 330 aa  85.9  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  28 
 
 		 347 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  28.12 
 
 		 351 aa  85.1  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  26.43 
 
 		 351 aa  85.1  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  26.43 
 
 		 351 aa  85.1  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  30.68 
 
 		 346 aa  85.1  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  26.43 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  25.45 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  28.87 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  28.38 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  28.38 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  28.38 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  28.38 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  32.37 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1331  TrkA-N  26.17 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.117696  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  28.19 
 
 		 339 aa  82.4  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  26.98 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  27.85 
 
 		 346 aa  82  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  26.87 
 
 		 330 aa  82  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  27.85 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  25.45 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  23.79 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  26.05 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  23.74 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  28.57 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  25.45 
 
 		 331 aa  79  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  25.89 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  31.69 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  21.71 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  25.78 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  26.57 
 
 		 355 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  25.23 
 
 		 325 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  27.04 
 
 		 531 aa  74.7  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 509 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  24.44 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  28.3 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  23.79 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  25.13 
 
 		 352 aa  72.4  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  23.66 
 
 		 341 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  22.91 
 
 		 359 aa  72  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  22.84 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  31.16 
 
 		 567 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  27.78 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  29.71 
 
 		 345 aa  68.9  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  23.45 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  27.84 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  26.7 
 
 		 517 aa  65.1  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  29.92 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  24.34 
 
 		 397 aa  61.6  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0418  TrkA-N domain protein  27.57 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  25.86 
 
 		 564 aa  58.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  20.89 
 
 		 541 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  31.9 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  28.35 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  23.18 
 
 		 324 aa  57  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  28.35 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  29.6 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  23 
 
 		 366 aa  55.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  24.66 
 
 		 359 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  28.33 
 
 		 356 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1399  TrkA-N domain protein  27.27 
 
 		 455 aa  54.3  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000200171  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0848  TrkA-N  28 
 
 		 347 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0423628  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  22.61 
 
 		 357 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  30.4 
 
 		 395 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  26.76 
 
 		 359 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  28.69 
 
 		 395 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  31.9 
 
 		 366 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  19.28 
 
 		 337 aa  53.1  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  25.11 
 
 		 620 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  21.29 
 
 		 350 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  24 
 
 		 376 aa  51.6  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  21.52 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  23.84 
 
 		 549 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  28.45 
 
 		 359 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  28.45 
 
 		 359 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  28.45 
 
 		 359 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  28 
 
 		 368 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  24.88 
 
 		 544 aa  48.5  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  22.42 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>