More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1866 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_2186  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  55.63 
 
 
574 aa  667    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0711  DNA-3-methyladenine glycosylase I  77.2 
 
 
578 aa  960    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105954  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1866  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  100 
 
 
579 aa  1209    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0127  hydrogenase-4 component G  67.07 
 
 
582 aa  862    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.548953  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1635  phage integrase family site specific recombinase  76.86 
 
 
578 aa  952    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0144556  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2769  hydrogenase-4, G subunit  50.61 
 
 
571 aa  615  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3709  hydrogenase-4, G subunit  50.61 
 
 
571 aa  616  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2634  hydrogenase-4, G subunit  50.43 
 
 
571 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2713  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  51.07 
 
 
575 aa  608  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1280  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  49.91 
 
 
575 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.637418  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2859  hydrogenase-4, G subunit  50.09 
 
 
571 aa  606  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4570  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  51.05 
 
 
571 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02571  hydrogenase 3, large subunit  50.53 
 
 
569 aa  592  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0968  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  50.53 
 
 
569 aa  592  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2857  formate hydrogenlyase, subunit E  50.53 
 
 
569 aa  592  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02536  hypothetical protein  50.53 
 
 
569 aa  592  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.576982  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0991  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  50.53 
 
 
569 aa  592  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3009  formate hydrogenlyase, subunit E  50.71 
 
 
569 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3972  formate hydrogenlyase, subunit E  50.71 
 
 
576 aa  593  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2846  formate hydrogenlyase, subunit E  50.53 
 
 
576 aa  592  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3155  formate hydrogenlyase, subunit E  50.71 
 
 
569 aa  592  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3001  formate hydrogenlyase subunit E  50.53 
 
 
569 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.33609  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3159  formate hydrogenlyase, subunit E  50.53 
 
 
569 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.146854 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3036  formate hydrogenlyase subunit E  50.53 
 
 
569 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143989 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3052  formate hydrogenlyase subunit E  50.53 
 
 
569 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.309808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2970  formate hydrogenlyase, subunit E  50.53 
 
 
569 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2430  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  49.65 
 
 
567 aa  587  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85735  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00990  Ni,Fe-hydrogenase III large subunit  51.13 
 
 
576 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1189  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  48.35 
 
 
555 aa  579  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.454918 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02379  hydrogenase 4, subunit  48.35 
 
 
555 aa  579  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1182  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  48.35 
 
 
555 aa  579  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3194  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  49.82 
 
 
569 aa  580  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02341  hypothetical protein  48.35 
 
 
555 aa  579  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2621  hydrogenase-4, G subunit  48.18 
 
 
555 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0183  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  48.86 
 
 
567 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0316  NADH-ubiquinone oxidoreductase  40.57 
 
 
561 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.371145  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2786  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  35.15 
 
 
557 aa  352  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2794  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  35.15 
 
 
557 aa  352  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0795  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  35.54 
 
 
525 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2464  NADH dehydrogenase (quinone)  33.86 
 
 
531 aa  281  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511351  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4284  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  31.5 
 
 
551 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1130  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  40.37 
 
 
402 aa  263  6.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1687  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  31.8 
 
 
530 aa  261  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  32.83 
 
 
537 aa  259  7e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  37.54 
 
 
359 aa  254  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00563551  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0028  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  39.55 
 
 
359 aa  253  6e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2505  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  38.38 
 
 
358 aa  252  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2590  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.18 
 
 
409 aa  250  5e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2227  NADH dehydrogenase (quinone)  34.11 
 
 
419 aa  246  8e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1522  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  36.97 
 
 
358 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  37.15 
 
 
366 aa  242  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.138643 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0699  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  32.43 
 
 
524 aa  242  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0595  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.29 
 
 
409 aa  242  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3020  ech hydrogenase subunit E  35.29 
 
 
359 aa  241  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1885  NADH dehydrogenase (quinone)  36.19 
 
 
360 aa  240  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0148  ech hydrogenase subunit E  36.69 
 
 
358 aa  239  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3524  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.77 
 
 
409 aa  239  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0959  membrane bound hydrogenase subunit mbhL  35.19 
 
 
406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.105572  normal  0.5876 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1086  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  36.97 
 
 
359 aa  233  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00746179  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0360  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  35.93 
 
 
359 aa  233  6e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4118  NADH dehydrogenase (quinone)  35.57 
 
 
358 aa  233  7.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433928  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0675  NADH dehydrogenase (quinone)  35.24 
 
 
414 aa  233  9e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1669  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  35.85 
 
 
360 aa  232  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0803  NADH dehydrogenase (quinone)  34.73 
 
 
359 aa  230  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2728  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  35.85 
 
 
359 aa  229  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.316127  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1425  ech hydrogenase subunit E  34.64 
 
 
361 aa  228  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3367  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  34.45 
 
 
359 aa  227  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1574  NADH dehydrogenase (quinone)  36.39 
 
 
362 aa  226  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.443946 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3189  NADH dehydrogenase (quinone)  32.55 
 
 
377 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.482242 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1745  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  36.19 
 
 
359 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364735  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_002936  DET1571  hydrogenase, group 4, HycE subunit, putative  30.53 
 
 
526 aa  220  7e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0265592  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1303  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  32.81 
 
 
478 aa  220  7e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0785  ech hydrogenase subunit E  35.2 
 
 
359 aa  219  7e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1102  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  35.39 
 
 
358 aa  220  7e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0553  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  34.82 
 
 
358 aa  219  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1449  hydrogenase, HycE subunit  31.15 
 
 
526 aa  218  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0376579  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07260  ech hydrogenase subunit E  33.05 
 
 
362 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0794783  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1123  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  32.57 
 
 
526 aa  217  4e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165135  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0867  hydrogenase, group 4, EchE subunit, putative  34.36 
 
 
359 aa  217  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195553  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0306  NADH dehydrogenase (quinone)  33.16 
 
 
374 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_770  hydrogenase, EchE subunit  34.08 
 
 
359 aa  213  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1317  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  31.36 
 
 
526 aa  212  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4501  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  32.31 
 
 
361 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0565202 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1197  NADH dehydrogenase (quinone)  33.05 
 
 
362 aa  210  5e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.450071  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1518  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  34.3 
 
 
375 aa  210  6e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.100115  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0401  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  34.3 
 
 
375 aa  210  7e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6069  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  30.27 
 
 
524 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289137 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13380  ech hydrogenase subunit E  34.45 
 
 
362 aa  208  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  29.62 
 
 
792 aa  208  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0434  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  33.77 
 
 
375 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.706219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  28.42 
 
 
794 aa  206  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0473  NADH dehydrogenase (quinone)  33.07 
 
 
375 aa  206  9e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.330146  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  29.41 
 
 
791 aa  205  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  34.15 
 
 
374 aa  205  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  28.93 
 
 
793 aa  203  8e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  31.59 
 
 
374 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0069  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  31.65 
 
 
359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4707  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  29.98 
 
 
486 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  29.44 
 
 
787 aa  196  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0325  putative formate hydrogenlyase subunit  28.83 
 
 
515 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>