More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0121 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0121  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0626  histidine kinase  38.22 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.657871  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1366  histidine kinase  34.91 
 
 		 371 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0489187  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1102  two-component sensor histidine kinase  31.76 
 
 		 407 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.588024  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0096  ATP-binding region ATPase domain protein  32.16 
 
 		 395 aa  118  9e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1357  sensor histidine kinase  33.89 
 
 		 396 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1235  sensor histidine kinase  33.89 
 
 		 353 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000222357  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0127  two-component sensor histidine kinase  34.13 
 
 		 435 aa  113  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.202899  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0137  sensor histidine kinase  31.03 
 
 		 375 aa  107  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  31.1 
 
 		 405 aa  97.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 421 aa  96.7  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  27.05 
 
 		 430 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  27.05 
 
 		 430 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1926  histidine kinase  31.4 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218105  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1279  sensor histidine kinase  24.89 
 
 		 388 aa  94  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00018737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1562  histidine kinase  31.55 
 
 		 317 aa  92.4  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1513  histidine kinase  31.55 
 
 		 317 aa  92.4  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0841  sensor histidine kinase  28.05 
 
 		 374 aa  91.3  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0909327  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0273  ATP-binding region ATPase domain protein  27.42 
 
 		 393 aa  89.7  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1188  sensor histidine kinase, putative  33.17 
 
 		 438 aa  89  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  25.2 
 
 		 427 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0885  histidine kinase  27.9 
 
 		 331 aa  87.4  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.096312  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 423 aa  87.8  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0529  sensor histidine kinase  27.63 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1774  histidine kinase  27.15 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  29.44 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  30 
 
 		 571 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  30.84 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0256  ATP-binding region ATPase domain protein  29.61 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1825  histidine kinase  30.48 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  27.35 
 
 		 448 aa  82.8  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1773  sensor histidine kinase  29.05 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1325  hypothetical protein  24.55 
 
 		 389 aa  82  0.000000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.219372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  29.77 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  29.77 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1439  histidine kinase  31.37 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0850045  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.81 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  29.34 
 
 		 571 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1791  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 489 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  25.77 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  27.03 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0491  signal transduction histidine kinase-like protein  28.31 
 
 		 617 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.146334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 479 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2063  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000411382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7070  histidine kinase  28.29 
 
 		 456 aa  79.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  28.1 
 
 		 351 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 436 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00289243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1817  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 351 aa  79  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1956  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 351 aa  79  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1963  sensor histidine kinase  29.05 
 
 		 357 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553892  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  25.32 
 
 		 584 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1993  sensor histidine kinase  29.05 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.237870000000001e-44 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0804  histidine kinase  29.21 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0156746  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4300  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 515 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 515 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4680  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 515 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 425 aa  76.3  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  26.23 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  24.2 
 
 		 480 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 496 aa  75.9  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 466 aa  75.9  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  26.23 
 
 		 392 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.96 
 
 		 463 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 600 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 500 aa  75.5  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  27.42 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4648  sensor histidine kinase  28.43 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00426  putative two-component system sensor kinase/response regulator fusion protein  26.75 
 
 		 1280 aa  75.5  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  25.84 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3145  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0153  histidine kinase  27.36 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.519807  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  23.31 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0387  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.01 
 
 		 502 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  26.23 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1545  histidine kinase  22.31 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6396  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.59 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  26.23 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  26.23 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1570  Signal transduction histidine kinase-like  27.83 
 
 		 666 aa  73.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.733845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2390  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 618 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.868312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1580  ATP-binding region ATPase domain protein  29.41 
 
 		 497 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 607 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  26.94 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  26.15 
 
 		 598 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1918  ATP-binding region, ATPase-like protein  30.34 
 
 		 935 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5391  histidine kinase  27.64 
 
 		 542 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067404 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  26.42 
 
 		 481 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  25.57 
 
 		 469 aa  72.8  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0124  sensor histidine kinase  26.11 
 
 		 356 aa  72.4  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  26.19 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000736417  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08080  signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 		 569 aa  72.4  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.672311  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0345  histidine kinase  27.86 
 
 		 498 aa  72.4  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>