More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0670 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 386 aa  790    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  42.64 
 
 		 402 aa  325  7e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  41.76 
 
 		 392 aa  301  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  40.11 
 
 		 394 aa  300  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  40.77 
 
 		 396 aa  300  4e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  40.16 
 
 		 411 aa  299  7e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  40.16 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  40.7 
 
 		 398 aa  296  4e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  40.33 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  39.67 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  41 
 
 		 401 aa  292  6e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  37.9 
 
 		 400 aa  292  7e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  39.78 
 
 		 396 aa  292  8e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  39.14 
 
 		 394 aa  292  9e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  39.78 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  39.89 
 
 		 392 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  39.78 
 
 		 396 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  37.33 
 
 		 397 aa  287  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  38.17 
 
 		 405 aa  279  7e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  37.3 
 
 		 403 aa  276  5e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  42.35 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  37.9 
 
 		 405 aa  269  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  38.54 
 
 		 390 aa  267  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  39.23 
 
 		 391 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  34.83 
 
 		 424 aa  263  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  37.37 
 
 		 417 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  39.08 
 
 		 401 aa  259  7e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  38.73 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  37.18 
 
 		 410 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  34.09 
 
 		 401 aa  249  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  35.71 
 
 		 389 aa  246  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  35.77 
 
 		 400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  34.09 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  35.66 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  35.99 
 
 		 395 aa  239  6.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  35.13 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  32.2 
 
 		 413 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  32.32 
 
 		 419 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  34.55 
 
 		 399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  34 
 
 		 400 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  33.94 
 
 		 427 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  30.96 
 
 		 411 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  33.33 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  33.83 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  32.77 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  32.31 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  34.12 
 
 		 402 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  32.56 
 
 		 409 aa  220  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  30.07 
 
 		 431 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  33.86 
 
 		 402 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  33.77 
 
 		 403 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  33.83 
 
 		 401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  32.15 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  32.48 
 
 		 390 aa  210  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  32.05 
 
 		 436 aa  209  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  33.06 
 
 		 439 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  30.15 
 
 		 406 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  35.54 
 
 		 448 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  29.35 
 
 		 403 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  30.36 
 
 		 419 aa  200  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  34.7 
 
 		 372 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  30.23 
 
 		 446 aa  199  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  34.7 
 
 		 395 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  32.83 
 
 		 402 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  32.13 
 
 		 364 aa  196  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 404 aa  196  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  36.14 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  32.66 
 
 		 373 aa  189  8e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  33.87 
 
 		 412 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  35.82 
 
 		 441 aa  186  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  31.04 
 
 		 424 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  28.8 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  34.18 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  29.2 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 		 389 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  30.64 
 
 		 369 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  32.32 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 		 304 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  33.11 
 
 		 443 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0132  metal dependent phosphohydrolase  31.37 
 
 		 457 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251031  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  30.97 
 
 		 362 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 		 372 aa  166  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3198  metal dependent phosphohydrolase  31.04 
 
 		 359 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3572  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 		 516 aa  166  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  36.91 
 
 		 356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0287  HD domain-containing protein  31.08 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  28.25 
 
 		 373 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3058  metal dependent phosphohydrolase  29.45 
 
 		 352 aa  159  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  29.41 
 
 		 488 aa  159  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  29.02 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  30.03 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0101  metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 		 360 aa  157  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3275  metal dependent phosphohydrolase  31.08 
 
 		 448 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.003044  normal  0.177194 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3124  metal dependent phosphohydrolase  36.94 
 
 		 341 aa  156  7e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  25.19 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>