263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3962 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  95.62 
 
 
457 aa  843    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
457 aa  910    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  69.8 
 
 
457 aa  628  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  69.37 
 
 
457 aa  622  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  63.46 
 
 
457 aa  595  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  38.91 
 
 
457 aa  319  6e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  38.48 
 
 
457 aa  309  6.999999999999999e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  36.98 
 
 
454 aa  282  9e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  36.82 
 
 
458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  36.82 
 
 
458 aa  264  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  33.77 
 
 
453 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  33.48 
 
 
453 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  36.15 
 
 
455 aa  223  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  32.19 
 
 
452 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0193  flagellar hook-associated protein FlgK  31.55 
 
 
452 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.363354  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4680  flagellar hook-associated protein FlgK  31.6 
 
 
429 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296928 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  30.66 
 
 
477 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  29.75 
 
 
477 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  29.39 
 
 
464 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  35.91 
 
 
637 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  32.59 
 
 
688 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  28.84 
 
 
478 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  32.43 
 
 
631 aa  149  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  34.17 
 
 
680 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  33.23 
 
 
681 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239.3  flagellar hook-associated protein  32.45 
 
 
386 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  29.76 
 
 
458 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  32.08 
 
 
686 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  32.46 
 
 
641 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  32.39 
 
 
682 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  33.54 
 
 
680 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  31.45 
 
 
686 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  33.12 
 
 
652 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  32.19 
 
 
641 aa  143  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  32.28 
 
 
682 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  31.15 
 
 
641 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  32.29 
 
 
683 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2953  flagellar hook-associated protein FlgK  32.21 
 
 
641 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  31.93 
 
 
641 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  31.78 
 
 
641 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  32.1 
 
 
541 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  31.95 
 
 
641 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  31.01 
 
 
640 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  31.34 
 
 
637 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  31.95 
 
 
641 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  27.54 
 
 
471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  33.14 
 
 
640 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  29.78 
 
 
638 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  30.12 
 
 
631 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  30.19 
 
 
676 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  28.7 
 
 
638 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  27.77 
 
 
480 aa  130  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  31.17 
 
 
920 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  28.41 
 
 
640 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  26.98 
 
 
456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  30.41 
 
 
539 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  31.35 
 
 
665 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  30.17 
 
 
553 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  30.17 
 
 
553 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  30.17 
 
 
553 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  30.17 
 
 
553 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  30.17 
 
 
553 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  29.46 
 
 
547 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  31.97 
 
 
647 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  29.46 
 
 
547 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  29.46 
 
 
547 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  29.46 
 
 
547 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  29.17 
 
 
547 aa  123  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  29.17 
 
 
547 aa  123  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  29.6 
 
 
657 aa  123  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  29.17 
 
 
547 aa  123  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1312  flagellar hook-associated protein  29.28 
 
 
639 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  29.17 
 
 
547 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2309  flagellar hook-associated protein  29.06 
 
 
638 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  28.87 
 
 
547 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  30.72 
 
 
549 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  28.7 
 
 
642 aa  121  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  26.05 
 
 
465 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  30.15 
 
 
695 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  31.01 
 
 
681 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  28.53 
 
 
637 aa  117  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  29.84 
 
 
645 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  29.38 
 
 
624 aa  117  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  29.38 
 
 
624 aa  117  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02919  Flagellar hook-associated protein  28.7 
 
 
680 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  30.67 
 
 
623 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  31.8 
 
 
623 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  29.05 
 
 
546 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  23.7 
 
 
531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  26.14 
 
 
685 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  27.88 
 
 
476 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  24.23 
 
 
489 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  26.14 
 
 
464 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  28.12 
 
 
653 aa  110  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  28.77 
 
 
660 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  30.06 
 
 
622 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  30.58 
 
 
642 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  28.28 
 
 
649 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  25.32 
 
 
452 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3642  flagellar hook-associated protein FlgK  24.78 
 
 
432 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>