284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3056 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 
265 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  99.62 
 
 
265 aa  517  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 
265 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 
265 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  95.47 
 
 
265 aa  499  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  91.7 
 
 
265 aa  485  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  91.32 
 
 
265 aa  484  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  91.32 
 
 
265 aa  480  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  90.91 
 
 
265 aa  480  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  77.57 
 
 
265 aa  425  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  76.81 
 
 
267 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  75.95 
 
 
267 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  80.3 
 
 
265 aa  417  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  74.05 
 
 
262 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  72.24 
 
 
266 aa  399  1e-110  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1630  flagellar biosynthesis protein FliR  76.45 
 
 
261 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  53.08 
 
 
260 aa  268  9e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  51.54 
 
 
260 aa  267  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002827  flagellar biosynthesis protein FliR  50.38 
 
 
260 aa  262  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  46.74 
 
 
260 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2296  flagellar biosynthesis protein FliR  50.38 
 
 
260 aa  245  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  47.06 
 
 
259 aa  240  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  47.3 
 
 
261 aa  222  5e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  47.2 
 
 
259 aa  221  1e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  45.08 
 
 
258 aa  212  4e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  44.66 
 
 
261 aa  212  6e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  48.15 
 
 
261 aa  208  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  47.01 
 
 
258 aa  206  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  45.65 
 
 
258 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  44.03 
 
 
258 aa  199  4e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  47.39 
 
 
258 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  47.39 
 
 
258 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  45.19 
 
 
258 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  44.08 
 
 
258 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  43.29 
 
 
253 aa  191  9e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  44.77 
 
 
258 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  41.95 
 
 
257 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  41.53 
 
 
247 aa  186  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  41.08 
 
 
261 aa  186  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  39.64 
 
 
260 aa  179  6e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  43.16 
 
 
262 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  40.61 
 
 
260 aa  175  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  41.7 
 
 
260 aa  174  1e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  40.33 
 
 
264 aa  174  1e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  42.86 
 
 
236 aa  171  8e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  41.94 
 
 
265 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001178  flagellar biosynthesis protein FliR  41.71 
 
 
258 aa  166  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.795861  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  38.6 
 
 
261 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  37.07 
 
 
259 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04965  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  40.18 
 
 
258 aa  165  7e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  38.56 
 
 
256 aa  165  7e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  36.44 
 
 
260 aa  165  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  38.24 
 
 
256 aa  165  9e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  36.71 
 
 
263 aa  164  1e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  38.46 
 
 
261 aa  162  4e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  38.46 
 
 
260 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  37.5 
 
 
259 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  38.46 
 
 
260 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  40.6 
 
 
259 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  38.46 
 
 
260 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  36.05 
 
 
260 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  36.91 
 
 
260 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  39.55 
 
 
260 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  39.74 
 
 
260 aa  153  3e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  34.48 
 
 
259 aa  153  3e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  41.98 
 
 
266 aa  153  3e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  39.32 
 
 
260 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  37.5 
 
 
257 aa  152  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2183  flagellar biosynthesis protein FliR  38.85 
 
 
261 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.59397e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  34.32 
 
 
261 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  37.1 
 
 
261 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  38.33 
 
 
260 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  39.55 
 
 
260 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1234  flagellar biosynthesis protein FliR  39.67 
 
 
261 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.14634e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  38.46 
 
 
260 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  38.46 
 
 
260 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  40.45 
 
 
260 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2727  flagellar biosynthesis protein FliR  40.24 
 
 
261 aa  148  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00116197  normal  0.508279 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  39.55 
 
 
260 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  39.55 
 
 
260 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  39.55 
 
 
260 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1698  flagellar biosynthetic protein FliR  40.24 
 
 
261 aa  148  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.12821e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  39.55 
 
 
260 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  39.55 
 
 
260 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  39.55 
 
 
260 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  36.68 
 
 
260 aa  148  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  37.67 
 
 
261 aa  148  1e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1692  flagellar biosynthesis protein FliR  39.26 
 
 
261 aa  147  1e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  5.55568e-06  normal  0.0138418 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2050  flagellar biosynthesis protein FliR  41.23 
 
 
261 aa  148  1e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.09328e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1071  flagellar biosynthesis protein FliR  38.46 
 
 
261 aa  148  1e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.09979e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  39.91 
 
 
264 aa  148  1e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  39.48 
 
 
264 aa  146  4e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  36.44 
 
 
264 aa  146  4e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  39.48 
 
 
264 aa  146  4e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  39.48 
 
 
264 aa  146  4e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  39.06 
 
 
264 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.10874e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  37.28 
 
 
259 aa  142  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 
247 aa  140  2e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  34.48 
 
 
256 aa  139  5e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  34.63 
 
 
247 aa  139  5e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>