More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1303 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  100 
 
 
255 aa  525  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  100 
 
 
255 aa  525  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  64.71 
 
 
256 aa  345  5e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  48.81 
 
 
277 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  49.41 
 
 
257 aa  232  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  48.41 
 
 
253 aa  228  8e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  49.61 
 
 
257 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  51.18 
 
 
259 aa  215  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  49.41 
 
 
257 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  49.41 
 
 
257 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  48.02 
 
 
255 aa  211  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  49.41 
 
 
257 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  49.01 
 
 
257 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  49.8 
 
 
257 aa  207  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  49.8 
 
 
257 aa  207  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  49.8 
 
 
257 aa  207  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  49.41 
 
 
257 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  49.02 
 
 
258 aa  204  8e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  42.8 
 
 
250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  46.92 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  47.58 
 
 
260 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  44.83 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  46.46 
 
 
260 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  48.57 
 
 
217 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  49.23 
 
 
212 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  43.11 
 
 
268 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  47.62 
 
 
206 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  45.83 
 
 
211 aa  175  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  50 
 
 
202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  50 
 
 
202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  48.21 
 
 
209 aa  173  2.9999999999999996e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  47.06 
 
 
199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  46.67 
 
 
207 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  46.11 
 
 
211 aa  169  5e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  42.42 
 
 
209 aa  168  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  42.42 
 
 
209 aa  168  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  47.64 
 
 
248 aa  168  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  47.73 
 
 
209 aa  167  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  42.13 
 
 
240 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  39.91 
 
 
283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  47.12 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  47.59 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  46.6 
 
 
210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  40.35 
 
 
283 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  44.97 
 
 
198 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  40.84 
 
 
209 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  44.97 
 
 
198 aa  165  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  48.35 
 
 
203 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  46.2 
 
 
201 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  46.2 
 
 
201 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  39.91 
 
 
283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  43.42 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  45.19 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  47.34 
 
 
204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  44.02 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  47.34 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  44.44 
 
 
198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  39.35 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  47.83 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  46.03 
 
 
236 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  44.15 
 
 
221 aa  162  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  44.97 
 
 
198 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  41.02 
 
 
308 aa  162  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  45.55 
 
 
214 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  45.55 
 
 
214 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  47.03 
 
 
198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  45.55 
 
 
214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  45.03 
 
 
214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  45.92 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  42.56 
 
 
235 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  39.83 
 
 
338 aa  161  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  44.56 
 
 
217 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  44.56 
 
 
217 aa  161  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  44.97 
 
 
198 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  47.87 
 
 
196 aa  160  1e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  45.05 
 
 
232 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  45.05 
 
 
232 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  44.02 
 
 
198 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  44.02 
 
 
198 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  44.02 
 
 
198 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  44.02 
 
 
198 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  44.09 
 
 
227 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  44.02 
 
 
198 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  45.18 
 
 
269 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  40.67 
 
 
219 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  45.95 
 
 
207 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  42.78 
 
 
198 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  46.63 
 
 
203 aa  159  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  40.72 
 
 
240 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  44.02 
 
 
193 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  44.97 
 
 
249 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  46.32 
 
 
214 aa  159  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  46.49 
 
 
208 aa  159  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  45.79 
 
 
198 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  42 
 
 
206 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  44.83 
 
 
210 aa  159  5e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  44.02 
 
 
198 aa  159  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  47.4 
 
 
214 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  47.4 
 
 
214 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  45.21 
 
 
214 aa  158  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>