46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3770 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3770  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 369 aa  716    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00240032  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3340  regulatory protein, LuxR  35.9 
 
 		 364 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.212677 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  29.66 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  25.74 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 383 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  28.77 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  28.14 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  31.86 
 
 		 381 aa  52.8  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  30.3 
 
 		 370 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  21.31 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 402 aa  49.7  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 586 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  41.1 
 
 		 188 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.12 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 229 aa  46.2  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  20.83 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 191 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  41.18 
 
 		 392 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_003296  RS04789  putative transcription regulator protein  38.33 
 
 		 232 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814651  normal  0.0984639 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  42.37 
 
 		 365 aa  43.5  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0241  LuxR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 216 aa  43.5  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  29.69 
 
 		 271 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  29.82 
 
 		 375 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  25.83 
 
 		 373 aa  43.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 588 aa  43.1  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 374 aa  43.1  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2058  metal dependent phosphohydrolase  38.67 
 
 		 521 aa  43.1  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.6 
 
 		 536 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  25.34 
 
 		 405 aa  42.7  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>