More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0821 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  73.47 
 
 		 574 aa  854    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 585 aa  1207    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  70.94 
 
 		 839 aa  864    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  45.71 
 
 		 584 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  45.25 
 
 		 603 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3423  acyl-CoA synthetase  45.01 
 
 		 601 aa  462  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  43.32 
 
 		 608 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1688  acyl-CoA synthetase  45.2 
 
 		 568 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  43.35 
 
 		 576 aa  432  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  43.35 
 
 		 576 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  43.27 
 
 		 563 aa  431  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  43.35 
 
 		 576 aa  431  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  43.35 
 
 		 573 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  43.17 
 
 		 573 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  35.74 
 
 		 936 aa  306  7e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  37.2 
 
 		 577 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  35.55 
 
 		 852 aa  303  4.0000000000000003e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  37.18 
 
 		 586 aa  297  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  35.83 
 
 		 4336 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  35.44 
 
 		 958 aa  293  6e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  36.01 
 
 		 3231 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  35.48 
 
 		 4336 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  36.48 
 
 		 4318 aa  284  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  35.68 
 
 		 4332 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  36.58 
 
 		 4342 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  36.23 
 
 		 4317 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 		 962 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 		 942 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  36.16 
 
 		 586 aa  280  5e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  35.67 
 
 		 4342 aa  279  9e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 586 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 		 586 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  36.44 
 
 		 4317 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  36.63 
 
 		 4317 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  34.86 
 
 		 1801 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  35.52 
 
 		 4317 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 947 aa  270  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  33.64 
 
 		 958 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  31.67 
 
 		 581 aa  266  8.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  31.85 
 
 		 581 aa  266  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 949 aa  265  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 1035 aa  263  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  35.36 
 
 		 706 aa  262  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  31.37 
 
 		 2762 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  36.29 
 
 		 3208 aa  259  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  33.64 
 
 		 2820 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3965  AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 		 613 aa  256  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666614  normal  0.454806 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 		 653 aa  256  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  33.04 
 
 		 1656 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  34.37 
 
 		 3235 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  33.6 
 
 		 1789 aa  251  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  34.08 
 
 		 1067 aa  250  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  32.68 
 
 		 3099 aa  250  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  32.72 
 
 		 2997 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.21 
 
 		 563 aa  246  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 		 608 aa  246  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  35.02 
 
 		 592 aa  244  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  31.74 
 
 		 2791 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 		 579 aa  243  9e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 		 648 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 611 aa  240  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 		 597 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 		 595 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 586 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 		 597 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  31.45 
 
 		 7122 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  34.38 
 
 		 1779 aa  238  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  33.22 
 
 		 755 aa  238  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1459  AMP-binding domain-containing protein  34.08 
 
 		 621 aa  237  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0838  AMP-binding domain-containing protein  34.08 
 
 		 621 aa  237  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2154  AMP-binding domain-containing protein  34.08 
 
 		 621 aa  237  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  32.5 
 
 		 6403 aa  236  9e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 		 602 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0427  AMP-binding enzyme  33.56 
 
 		 621 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0523  AMP-binding enzyme  33.56 
 
 		 621 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.746199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1849  AMP-binding domain-containing protein  33.56 
 
 		 621 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 614 aa  235  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  33.64 
 
 		 1776 aa  234  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  32.73 
 
 		 2250 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2099  AMP-binding domain-containing protein  33.27 
 
 		 622 aa  231  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335161  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 701 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 578 aa  228  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  32.28 
 
 		 1474 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17520  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.08 
 
 		 559 aa  226  9e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  31.63 
 
 		 588 aa  226  9e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  29.81 
 
 		 1753 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.5 
 
 		 546 aa  225  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11209  acyl-CoA synthetase  31.73 
 
 		 578 aa  224  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  33.33 
 
 		 2721 aa  224  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  30.04 
 
 		 725 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  33.46 
 
 		 610 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5195  amino acid adenylation domain protein  28.47 
 
 		 2753 aa  223  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.628302 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  29.42 
 
 		 3718 aa  223  7e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1754  acyl-CoA synthetase  29.59 
 
 		 564 aa  223  8e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0433  AMP-binding enzyme family protein  29.59 
 
 		 559 aa  223  9e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 		 725 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18360  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.79 
 
 		 577 aa  223  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 582 aa  223  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  33.27 
 
 		 599 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2049  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 		 547 aa  222  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.998714  normal  0.345074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>