More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3423 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  100 
 
 
233 aa  450  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  90.13 
 
 
232 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  48.21 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  47.8 
 
 
224 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  50.22 
 
 
226 aa  164  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  44.77 
 
 
226 aa  161  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  51.79 
 
 
220 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  46.4 
 
 
224 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  43.58 
 
 
225 aa  136  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.33 
 
 
221 aa  135  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  40.37 
 
 
265 aa  134  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3194  peptidase S16 lon domain protein  40.95 
 
 
258 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  38.94 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  38.05 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  35.19 
 
 
213 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.32 
 
 
233 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.14 
 
 
213 aa  98.6  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  34.13 
 
 
211 aa  95.5  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  36.71 
 
 
216 aa  95.1  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  35.75 
 
 
212 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  35.75 
 
 
212 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  34.07 
 
 
220 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.3 
 
 
216 aa  92.4  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  34.12 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  35.45 
 
 
222 aa  89.4  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  29.38 
 
 
218 aa  89  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  31.9 
 
 
220 aa  88.6  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  35.32 
 
 
196 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.78 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  34.95 
 
 
218 aa  88.2  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  31.9 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  36.06 
 
 
216 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  34.78 
 
 
213 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  33.33 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  30.95 
 
 
218 aa  85.9  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  33.01 
 
 
217 aa  85.9  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  30.52 
 
 
218 aa  85.9  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  30.81 
 
 
218 aa  85.1  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  34.09 
 
 
196 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2324  peptidase S16 lon domain protein  34.18 
 
 
203 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.61107 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  29.25 
 
 
816 aa  84.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.5 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.89 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  35.08 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  35.78 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.72 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  36.72 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  39.86 
 
 
196 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.88 
 
 
196 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1319  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.68 
 
 
202 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.276995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  32.86 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1749  peptidase S16, ATP-dependent protease La  31.05 
 
 
798 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0163826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3724  ATP-dependent protease La  31.05 
 
 
798 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.639562  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.09 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1883  Lon-A peptidase  29.17 
 
 
803 aa  72  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3695  Lon-A peptidase  31.51 
 
 
798 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  39.2 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2513  ATP-dependent protease La  28.37 
 
 
813 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  30.52 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0056  ATP-dependent protease La  28.3 
 
 
825 aa  71.2  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  32.71 
 
 
200 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.35 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  42.15 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  30.99 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  30.99 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  30.99 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  30.99 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  31.67 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  30.99 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  30.99 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  26.89 
 
 
817 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  30.99 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  39.84 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1382  Lon-A peptidase  28.7 
 
 
803 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  27.23 
 
 
818 aa  70.1  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  30.52 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  32.09 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.63 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.09 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  37.98 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.09 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2052  ATP-dependent protease La  29.68 
 
 
798 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155836  normal  0.0687597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4129  ATP-dependent protease La  27.43 
 
 
825 aa  69.3  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.170203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 
804 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 
804 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.73 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  31.65 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  30.88 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1294  endopeptidase La  29.95 
 
 
805 aa  68.6  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0346664 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  30.19 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4663  peptidase S16 lon domain protein  34.15 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112882  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  28.37 
 
 
808 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  28.12 
 
 
806 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  32.26 
 
 
815 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1744  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
798 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484284  hitchhiker  0.00114156 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0821  ATP-dependent protease LA  27.7 
 
 
787 aa  67.8  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0118017  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  28.44 
 
 
828 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.16 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5918  ATP-dependent protease La  26.99 
 
 
829 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>