More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2663 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  90.3 
 
 
408 aa  704    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  100 
 
 
408 aa  805    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  41.02 
 
 
409 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  43.24 
 
 
423 aa  259  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  41.89 
 
 
421 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  39.36 
 
 
404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  39.02 
 
 
407 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  38.56 
 
 
402 aa  243  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  39.02 
 
 
407 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  38.78 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6190  cytochrome P450  35.99 
 
 
406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  37.71 
 
 
419 aa  233  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  38.11 
 
 
398 aa  229  9e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.45 
 
 
405 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  36.79 
 
 
401 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  36.5 
 
 
417 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  36.03 
 
 
405 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  38.73 
 
 
426 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  34.81 
 
 
405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  35.32 
 
 
417 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  38.6 
 
 
419 aa  213  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  34.34 
 
 
417 aa  212  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  34.69 
 
 
407 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  35.66 
 
 
405 aa  210  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  35.14 
 
 
398 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  35.58 
 
 
407 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  36.09 
 
 
410 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  34.76 
 
 
387 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  35.03 
 
 
399 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  32.82 
 
 
410 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  38.34 
 
 
417 aa  206  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  35.71 
 
 
429 aa  206  8e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  34.79 
 
 
406 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  36.12 
 
 
423 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  40 
 
 
414 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  34.53 
 
 
402 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  34 
 
 
410 aa  202  9e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.02 
 
 
420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  38.4 
 
 
450 aa  201  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  38.86 
 
 
464 aa  199  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  36.66 
 
 
400 aa  199  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  32.64 
 
 
399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  32.47 
 
 
406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  35.47 
 
 
412 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  34.84 
 
 
409 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  35.34 
 
 
402 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  32.92 
 
 
408 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  33.66 
 
 
412 aa  196  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  33.76 
 
 
404 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  35.41 
 
 
398 aa  196  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  39 
 
 
402 aa  195  9e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  40 
 
 
357 aa  196  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  33.25 
 
 
411 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  35.04 
 
 
418 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  40.4 
 
 
418 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  38.92 
 
 
423 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  34.64 
 
 
436 aa  195  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  34.09 
 
 
409 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  32.74 
 
 
415 aa  193  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  41.53 
 
 
400 aa  193  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  33.25 
 
 
408 aa  193  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  35.71 
 
 
392 aa  192  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  39.93 
 
 
399 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  38.82 
 
 
406 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  38.82 
 
 
406 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  38.82 
 
 
406 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  35.71 
 
 
427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  31.39 
 
 
412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0342  cytochrome P450  36.34 
 
 
407 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  35.73 
 
 
438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  34.17 
 
 
390 aa  190  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  33.5 
 
 
429 aa  189  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  36.58 
 
 
400 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  32.75 
 
 
395 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  33.17 
 
 
402 aa  188  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  35.35 
 
 
400 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  35.74 
 
 
395 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  33.5 
 
 
408 aa  187  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  34.41 
 
 
417 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  37.07 
 
 
407 aa  186  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  32.32 
 
 
421 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  37.77 
 
 
430 aa  186  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  31.17 
 
 
414 aa  186  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  31.51 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  34.45 
 
 
395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  33.06 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  33.92 
 
 
411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  36.05 
 
 
390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  32.77 
 
 
417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  33.67 
 
 
422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  31.05 
 
 
422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  36.02 
 
 
430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  32.59 
 
 
443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  30.41 
 
 
412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  35.2 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  32.26 
 
 
412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  31.9 
 
 
398 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  35.05 
 
 
423 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  35.16 
 
 
393 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  31.46 
 
 
400 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>