178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1191 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1191  amidohydrolase  100 
 
 		 359 aa  698    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1302  amidohydrolase  90.81 
 
 		 359 aa  596  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2244  amidohydrolase  68.89 
 
 		 367 aa  464  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.209508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  57.42 
 
 		 356 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1562  amidohydrolase 3  55.25 
 
 		 362 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  normal  0.0640888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4010  amidohydrolase  56.74 
 
 		 361 aa  348  9e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12929  hypothetical protein  52.39 
 
 		 370 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0687  normal  0.519945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2182  amidohydrolase  52.26 
 
 		 360 aa  330  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  0.931322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09720  Pro-Hyp dipeptidase  53.63 
 
 		 354 aa  323  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.885607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1281  amidohydrolase  54.08 
 
 		 364 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1940  amidohydrolase  51.91 
 
 		 368 aa  315  6e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1960  amidohydrolase  51.64 
 
 		 368 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2006  amidohydrolase  51.64 
 
 		 368 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.722686 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11020  amidohydrolase, imidazolonepropionase  48.32 
 
 		 366 aa  311  7.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.161229  normal  0.0546284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3462  amidohydrolase 3  54.72 
 
 		 365 aa  310  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4181  amidohydrolase  51.96 
 
 		 362 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1397  amidohydrolase  51.25 
 
 		 359 aa  300  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  decreased coverage  0.00549847 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2226  amidohydrolase  50 
 
 		 360 aa  297  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000139869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3262  amidohydrolase  49.02 
 
 		 361 aa  296  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23760  amidohydrolase, imidazolonepropionase  49.45 
 
 		 378 aa  293  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2486  amidohydrolase  47.5 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445092  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1166  amidohydrolase  52.81 
 
 		 373 aa  288  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1469  amidohydrolase  49.18 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1612  amidohydrolase  46.75 
 
 		 358 aa  272  6e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0569822  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2082  amidohydrolase  47.74 
 
 		 357 aa  269  5.9999999999999995e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09960  amidohydrolase, imidazolonepropionase  48.07 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0916327  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3142  amidohydrolase  47.08 
 
 		 359 aa  249  7e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000508689  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0984  amidohydrolase  42.39 
 
 		 358 aa  227  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000713577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  28.57 
 
 		 407 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  29.83 
 
 		 440 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  28.93 
 
 		 426 aa  93.6  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.84 
 
 		 426 aa  92.8  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  29.72 
 
 		 440 aa  92.8  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  26.5 
 
 		 430 aa  92  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  27.66 
 
 		 390 aa  90.5  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  26.7 
 
 		 432 aa  89.7  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  30.83 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  27.6 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  27.57 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  31.03 
 
 		 437 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  32.38 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  26.35 
 
 		 407 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  29.82 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  28.49 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  29.82 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  29.82 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  28.61 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  27.92 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  31.87 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  32.92 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  25.76 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  26.16 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1571  amidohydrolase  29.08 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0206923  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  26.33 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  26.82 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  27.3 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  30.56 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  30.61 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  30.96 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  30.95 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  26.48 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2402  amidohydrolase  29.57 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  30.23 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  28.29 
 
 		 428 aa  75.9  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  28.25 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  26.61 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  31.33 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  31.33 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  31.33 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  29.61 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  27.59 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  29.85 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  27.22 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  29.26 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  31.97 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  37.08 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  37.08 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  37.08 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  33.05 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  30.04 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  33.33 
 
 		 433 aa  72  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  28.49 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  25.41 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  33.5 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  27.71 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  28.29 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  27.25 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  24.73 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  28.91 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  28.89 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  34.03 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  29.75 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  24.16 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  32.12 
 
 		 461 aa  66.2  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  25 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4333  amidohydrolase  27.57 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.48776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  26.18 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  25.63 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  30.77 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  28.57 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>