68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0721 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  100 
 
 		 282 aa  564  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  57.36 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  57.36 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  57.36 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  56.59 
 
 		 173 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  57.26 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  57.26 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  48.44 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  58.93 
 
 		 278 aa  136  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  61 
 
 		 141 aa  125  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  58 
 
 		 151 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  58 
 
 		 135 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  56.64 
 
 		 138 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0706  hypothetical protein  49.02 
 
 		 171 aa  112  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300244  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  53.4 
 
 		 131 aa  112  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  47.66 
 
 		 149 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  47.66 
 
 		 149 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  47.66 
 
 		 149 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  47.66 
 
 		 149 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  46.46 
 
 		 137 aa  98.2  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  43.43 
 
 		 135 aa  89.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  40.4 
 
 		 147 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  39.39 
 
 		 148 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  37.61 
 
 		 148 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  33.66 
 
 		 119 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  42 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  36.19 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  36 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  36 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  29.57 
 
 		 134 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  33.06 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  29.79 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  31.91 
 
 		 154 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  29.79 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  27.83 
 
 		 220 aa  57  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  34.69 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  30.61 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  29.17 
 
 		 138 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  26.23 
 
 		 187 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  32.38 
 
 		 159 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  28.7 
 
 		 133 aa  53.1  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  32.98 
 
 		 223 aa  52.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  32.69 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  32.69 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  36.36 
 
 		 125 aa  52  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  26.36 
 
 		 115 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  32.69 
 
 		 223 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  24.03 
 
 		 157 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  27.66 
 
 		 137 aa  51.2  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  50.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  33 
 
 		 130 aa  49.7  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  32.95 
 
 		 131 aa  49.3  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  29.35 
 
 		 113 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  26.23 
 
 		 147 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  30.28 
 
 		 123 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  31.25 
 
 		 136 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  25.4 
 
 		 158 aa  46.2  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  29.13 
 
 		 154 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5104  protein of unknown function DUF583  25.51 
 
 		 199 aa  45.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  28.45 
 
 		 131 aa  45.8  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  28.74 
 
 		 148 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  28.7 
 
 		 149 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  26.23 
 
 		 161 aa  44.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  26.17 
 
 		 184 aa  45.1  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  27.43 
 
 		 131 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1567  hypothetical protein  34.15 
 
 		 118 aa  42.4  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04806  cell shape determination protein CcmA  28.89 
 
 		 102 aa  42.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  24.3 
 
 		 122 aa  42  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>