148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0817 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  100 
 
 
226 aa  451  1e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  51.41 
 
 
171 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  48.28 
 
 
191 aa  139  5e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  47.59 
 
 
175 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  40.45 
 
 
174 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  38.89 
 
 
179 aa  125  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.44 
 
 
179 aa  125  8e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.67 
 
 
180 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  38.33 
 
 
179 aa  121  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  38.33 
 
 
179 aa  121  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  38.33 
 
 
179 aa  121  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  38.33 
 
 
179 aa  121  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  38.33 
 
 
179 aa  121  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.78 
 
 
179 aa  121  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.78 
 
 
179 aa  121  1e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  44.22 
 
 
172 aa  120  2e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  40.54 
 
 
165 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0852  superoxide dismutase, copper/zinc binding  53.47 
 
 
183 aa  119  5e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  39.31 
 
 
178 aa  119  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  41.29 
 
 
169 aa  118  8e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.76 
 
 
172 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.5 
 
 
169 aa  111  1e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  42.55 
 
 
172 aa  108  8e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  39.05 
 
 
172 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  44.9 
 
 
156 aa  105  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  41.67 
 
 
208 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.78 
 
 
169 aa  101  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  42.03 
 
 
184 aa  99.8  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  42.37 
 
 
182 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2378  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.57 
 
 
177 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.64 
 
 
183 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.13 
 
 
176 aa  95.9  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  42.28 
 
 
173 aa  95.9  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.64 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.11 
 
 
183 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  44.17 
 
 
179 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  35.63 
 
 
171 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.31 
 
 
180 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  9.37306e-06 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.93 
 
 
212 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.86 
 
 
165 aa  88.6  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.2 
 
 
175 aa  87.8  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  35.71 
 
 
180 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.06 
 
 
179 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.41 
 
 
175 aa  87  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  33.17 
 
 
510 aa  87  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2833  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.75 
 
 
177 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916793  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.41 
 
 
177 aa  84.3  1e-15  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  43.52 
 
 
191 aa  84.7  1e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1561  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.61 
 
 
172 aa  83.6  2e-15  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.34 
 
 
179 aa  81.6  8e-15  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  39.84 
 
 
203 aa  81.6  8e-15  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  34.95 
 
 
210 aa  81.6  8e-15  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  32.91 
 
 
194 aa  80.5  2e-14  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  41.46 
 
 
192 aa  80.5  2e-14  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  35.37 
 
 
185 aa  80.5  2e-14  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.54 
 
 
210 aa  79  6e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.69 
 
 
185 aa  78.6  7e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.5 
 
 
201 aa  78.2  9e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4679  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.5 
 
 
201 aa  78.2  9e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.76 
 
 
183 aa  77.8  1e-13  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.37 
 
 
189 aa  77  2e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.98 
 
 
185 aa  77.4  2e-13  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7975  Cu/Zn superoxide dismutase-like protein  34.91 
 
 
226 aa  76.6  3e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal  0.114926 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.5 
 
 
180 aa  75.9  4e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.72 
 
 
171 aa  73.6  2e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.72 
 
 
171 aa  73.2  3e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.5 
 
 
206 aa  73.6  3e-12  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4827  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.67 
 
 
201 aa  72.8  4e-12  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.661461  normal  0.600787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.36 
 
 
214 aa  72.8  4e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0733  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.54 
 
 
175 aa  71.6  1e-11  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000189816  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2922  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.04 
 
 
183 aa  71.2  1e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719659  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  39.64 
 
 
158 aa  71.6  1e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.75437e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2380  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  32.53 
 
 
220 aa  70.1  3e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.69 
 
 
190 aa  69.7  3e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03563  superoxide dismutase  36.24 
 
 
200 aa  68.6  7e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  31.85 
 
 
173 aa  65.5  6e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  36.81 
 
 
172 aa  65.5  7e-10  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  35.14 
 
 
180 aa  64.3  1e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0702  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.1 
 
 
172 aa  64.7  1e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123655  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.72 
 
 
183 aa  63.9  2e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0978  copper/zinc superoxide dismutase  35.67 
 
 
189 aa  62.8  5e-09  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  35.03 
 
 
174 aa  61.6  1e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3728  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  30.34 
 
 
244 aa  61.6  1e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  35.62 
 
 
173 aa  60.1  2e-08  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0735  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.52 
 
 
235 aa  60.5  2e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  35.62 
 
 
173 aa  60.8  2e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  35.62 
 
 
173 aa  60.8  2e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  3.59959e-05  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  35.62 
 
 
173 aa  60.8  2e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  35.62 
 
 
173 aa  60.8  2e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  35.62 
 
 
178 aa  60.8  2e-08  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.93 
 
 
182 aa  60.5  2e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  35.62 
 
 
173 aa  60.8  2e-08  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  35.62 
 
 
173 aa  60.8  2e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  35.62 
 
 
173 aa  60.8  2e-08  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.74216e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1082  copper/zinc superoxide dismutase  35.43 
 
 
177 aa  59.7  4e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.302029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3315  copper/zinc superoxide dismutase  34.68 
 
 
195 aa  59.7  4e-08  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151154  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1154  copper/zinc superoxide dismutase  35.43 
 
 
177 aa  59.7  4e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1419  copper/zinc superoxide dismutase  35.43 
 
 
177 aa  59.7  4e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0294455 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  36.84 
 
 
178 aa  59.3  5e-08  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3445  superoxide dismutase  36.73 
 
 
201 aa  58.9  6e-08  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>