More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1361 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1361  carbamoyl phosphate synthase small subunit  100 
 
 		 376 aa  781    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2310  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.47 
 
 		 374 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1858  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.88 
 
 		 373 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1273  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.88 
 
 		 374 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1771  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.93 
 
 		 374 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0224697  normal  0.089739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1898  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.2 
 
 		 374 aa  398  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3359  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  49.87 
 
 		 381 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.365692  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1613  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.4 
 
 		 376 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0266912  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2113  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.47 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000982338  normal  0.988223 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2459  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.4 
 
 		 369 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2349  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.2 
 
 		 366 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0156  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.87 
 
 		 369 aa  386  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.983052  normal  0.416855 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0107  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.73 
 
 		 367 aa  385  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0995  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.2 
 
 		 381 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.055995  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2215  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  47.76 
 
 		 381 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000311671  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2504  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.83 
 
 		 381 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.323519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1774  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.63 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0283036 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00036  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  48.56 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3567  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  48.56 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0072  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.07 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.399436  normal  0.955538 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2083  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.34 
 
 		 373 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0033  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.56 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0032  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.56 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4055  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  48.67 
 
 		 386 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.103191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2299  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.34 
 
 		 369 aa  384  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000401664  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0036  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.56 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0070  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.07 
 
 		 391 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3404  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.59 
 
 		 385 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000786314 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02244  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  48.13 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0231375  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0035  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.56 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3075  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.88 
 
 		 381 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335125  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0074  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.81 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00035  hypothetical protein  48.56 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0070  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.81 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0035  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.56 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3019  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  48.66 
 
 		 377 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2527  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.54 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3359  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  48.67 
 
 		 386 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.663891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3578  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.79 
 
 		 381 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0674639  normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0073  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.54 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2940  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.13 
 
 		 386 aa  378  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185194  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0878  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  49.87 
 
 		 378 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3623  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.56 
 
 		 382 aa  381  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2194  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  49.87 
 
 		 373 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0218  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.26 
 
 		 367 aa  381  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0975  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.86 
 
 		 381 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00141878  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2839  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.66 
 
 		 390 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00340084  normal  0.0286195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1456  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  48.03 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2392  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  48.03 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2032  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  50.41 
 
 		 383 aa  378  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000277554  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3648  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.47 
 
 		 382 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0951  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  50 
 
 		 352 aa  376  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113034  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1250  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  49.73 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2783  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.31 
 
 		 381 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259596  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3086  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  48.54 
 
 		 381 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0580438  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3526  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.27 
 
 		 386 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0009  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50 
 
 		 391 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.35972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1475  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.77 
 
 		 381 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0587  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.77 
 
 		 381 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.368687  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3401  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48 
 
 		 391 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00720177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0564  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.77 
 
 		 381 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1141  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.2 
 
 		 386 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0591  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.75 
 
 		 382 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0770  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.77 
 
 		 381 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76287  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1608  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.51 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4432  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.38 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0585  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.4 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0152244  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1683  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  50.14 
 
 		 359 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104913  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3305  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.13 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.314757  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0478  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  46.51 
 
 		 383 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2729  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  46.54 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1968  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.47 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.837999  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004479  carbamoyl-phosphate synthase small chain  47.72 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1281  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.77 
 
 		 381 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.697849  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1051  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.098868  hitchhiker  0.0000017806 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1505  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.51 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188244  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1019  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  46.37 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1853  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.11 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0936768  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4035  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.65 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0975  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  46.76 
 
 		 379 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1127  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  46.74 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.390679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2868  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.85 
 
 		 384 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00228162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0778  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  46.38 
 
 		 376 aa  368  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.42563  hitchhiker  0.000147727 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0372  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  49.46 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.386907  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1256  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.31 
 
 		 391 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0809  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.38 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0848  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  45.6 
 
 		 398 aa  368  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.287672 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00912  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.49 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0965  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.47 
 
 		 386 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0738044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1003  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.2 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0354323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1261  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.38 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0131767  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1290  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.38 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0948613  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0967  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.2 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00370508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0896  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  47.61 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.348294  normal  0.560722 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2353  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  48.79 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00528586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4410  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.41 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2615  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.19 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218889  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2122  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.33 
 
 		 391 aa  367  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.618886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1148  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  45.62 
 
 		 387 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0863472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1731  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.34 
 
 		 380 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>