More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2349 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2349  carbamoyl phosphate synthase small subunit  100 
 
 		 366 aa  758    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2113  carbamoyl phosphate synthase small subunit  77.75 
 
 		 371 aa  607  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000982338  normal  0.988223 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0218  carbamoyl phosphate synthase small subunit  74.73 
 
 		 367 aa  579  1e-164  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2299  carbamoyl phosphate synthase small subunit  75.55 
 
 		 369 aa  580  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000401664  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2459  carbamoyl phosphate synthase small subunit  73.63 
 
 		 369 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0156  carbamoyl phosphate synthase small subunit  73.9 
 
 		 369 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.983052  normal  0.416855 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0107  carbamoyl phosphate synthase small subunit  69.59 
 
 		 367 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1613  carbamoyl phosphate synthase small subunit  55.91 
 
 		 376 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0266912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1273  carbamoyl phosphate synthase small subunit  55.73 
 
 		 374 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2032  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  56.18 
 
 		 383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000277554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1771  carbamoyl phosphate synthase small subunit  53.6 
 
 		 374 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0224697  normal  0.089739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2194  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  54.18 
 
 		 373 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1858  carbamoyl phosphate synthase small subunit  53.87 
 
 		 373 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4055  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  53.6 
 
 		 386 aa  396  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.103191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1898  carbamoyl phosphate synthase small subunit  54.13 
 
 		 374 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2310  carbamoyl phosphate synthase small subunit  54.13 
 
 		 374 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2643  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  54.81 
 
 		 374 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1683  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  54.32 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104913  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3359  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  53.48 
 
 		 386 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.663891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2215  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  52.38 
 
 		 381 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000311671  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0591  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.73 
 
 		 382 aa  391  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2527  carbamoyl phosphate synthase small subunit  54.4 
 
 		 373 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0072  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.2 
 
 		 382 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.399436  normal  0.955538 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3648  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.73 
 
 		 382 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02244  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  51.61 
 
 		 440 aa  384  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0231375  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1250  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  52.85 
 
 		 372 aa  387  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0070  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.2 
 
 		 391 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0881  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  52.49 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1968  carbamoyl phosphate synthase small subunit  52 
 
 		 379 aa  385  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.837999  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2083  carbamoyl phosphate synthase small subunit  54.13 
 
 		 373 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1361  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.2 
 
 		 376 aa  385  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0896  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  51.47 
 
 		 378 aa  386  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.348294  normal  0.560722 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00036  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  50.67 
 
 		 382 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3567  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  50.67 
 
 		 382 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0074  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.2 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0036  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.67 
 
 		 382 aa  383  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1127  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  52.28 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.390679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0070  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.2 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1620  carbamoyl phosphate synthase small subunit  53.08 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.394714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0035  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.67 
 
 		 382 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0035  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.67 
 
 		 382 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0033  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.67 
 
 		 382 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00035  hypothetical protein  50.67 
 
 		 382 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0032  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.67 
 
 		 391 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2328  carbamoyl phosphate synthase small subunit  53.08 
 
 		 373 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2191  carbamoyl phosphate synthase small subunit  52.15 
 
 		 372 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.352304 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3019  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  51.21 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3623  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.67 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0372  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  50.7 
 
 		 359 aa  378  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.386907  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2240  carbamoyl phosphate synthase small subunit  52.01 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2729  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  49.87 
 
 		 387 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2002  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  51.65 
 
 		 379 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2282  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  53.05 
 
 		 385 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332421  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0009  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.2 
 
 		 391 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.35972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0073  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.93 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1853  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.2 
 
 		 378 aa  375  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0936768  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0585  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.21 
 
 		 384 aa  378  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0152244  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0938  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  50.4 
 
 		 385 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.742428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0120  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  51.18 
 
 		 380 aa  375  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0778  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  50.53 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.42563  hitchhiker  0.000147727 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2353  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  52.53 
 
 		 358 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00528586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3841  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.73 
 
 		 382 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00912  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.79 
 
 		 416 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1774  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.74 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0283036 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004479  carbamoyl-phosphate synthase small chain  50.67 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1731  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.73 
 
 		 380 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2839  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.53 
 
 		 390 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00340084  normal  0.0286195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4035  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.27 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0592  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  51.73 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3203  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  52.86 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1942  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.33 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230816  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0698  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  48.66 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.110228 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3404  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50 
 
 		 385 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000786314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2610  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  49.6 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2823  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  49.1 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4410  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.19 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1371  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.54 
 
 		 402 aa  368  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0878  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  51.75 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2122  carbamoyl phosphate synthase small subunit  52.02 
 
 		 391 aa  368  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.618886 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1811  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.46 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0542874 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1431  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.54 
 
 		 382 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1456  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  48.81 
 
 		 390 aa  368  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3075  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335125  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02880  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  51.25 
 
 		 364 aa  368  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.422195  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4932  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  50 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259128 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0554  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  50.93 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1982  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  49.73 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.157941  normal  0.0125598 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1776  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  50.4 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0616181  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3578  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.67 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0674639  normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2392  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  48.81 
 
 		 390 aa  368  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3459  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0951  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  50 
 
 		 352 aa  366  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113034  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4725  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.6 
 
 		 378 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4590  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.6 
 
 		 386 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2615  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.08 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3196  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.8 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0368063 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5478  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.6 
 
 		 378 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0713  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.6 
 
 		 382 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.123455 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3086  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  49.34 
 
 		 381 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0580438  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0392  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.74 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.166847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>