More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0403 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 315 aa  629  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  53.8 
 
 		 319 aa  343  1e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  52.19 
 
 		 321 aa  338  5e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  51.56 
 
 		 321 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  52.19 
 
 		 321 aa  330  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  50.94 
 
 		 321 aa  328  8e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0282  KpsF/GutQ family protein  51.58 
 
 		 321 aa  326  4.0000000000000003e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  51.72 
 
 		 322 aa  324  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  49.35 
 
 		 320 aa  322  5e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  49.35 
 
 		 320 aa  322  5e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  48.75 
 
 		 320 aa  321  8e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  50.16 
 
 		 326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  50.47 
 
 		 322 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  49.06 
 
 		 324 aa  319  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  50.47 
 
 		 322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  50.8 
 
 		 323 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  48.09 
 
 		 323 aa  316  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  50.95 
 
 		 321 aa  316  4e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1749  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  53.48 
 
 		 319 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1665  KpsF/GutQ family protein  48.73 
 
 		 320 aa  314  9.999999999999999e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.309824  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  51.12 
 
 		 323 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  47.94 
 
 		 324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0006  KpsF/GutQ family protein  50.31 
 
 		 357 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  47.77 
 
 		 324 aa  312  4.999999999999999e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  48.26 
 
 		 333 aa  312  4.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  49.36 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  48.11 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  46.18 
 
 		 326 aa  310  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  49.04 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  49.36 
 
 		 324 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  48.09 
 
 		 344 aa  308  8e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  48.41 
 
 		 330 aa  308  9e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1886  arabinose 5-phosphate isomerase  51.76 
 
 		 317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.106886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  47.04 
 
 		 331 aa  307  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.96 
 
 		 328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  49.68 
 
 		 324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  48.9 
 
 		 333 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  47.32 
 
 		 326 aa  305  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  49.04 
 
 		 324 aa  305  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  51.44 
 
 		 325 aa  305  7e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0503  arabinose 5-phosphate isomerase  49.84 
 
 		 324 aa  305  8.000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  45.4 
 
 		 339 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.12 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  47.95 
 
 		 335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1810  KpsF/GutQ  51.27 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220338  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  47.17 
 
 		 324 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.96 
 
 		 328 aa  302  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.96 
 
 		 342 aa  302  6.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  45.74 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2308  KpsF/GutQ family protein  46.47 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1114  arabinose 5-phosphate isomerase  49.84 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.96 
 
 		 357 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3603  KpsF/GutQ family protein  47.8 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.478278 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.12 
 
 		 345 aa  300  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2063  KpsF/GutQ family protein  47.78 
 
 		 321 aa  300  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.806095  normal  0.101433 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  45.54 
 
 		 340 aa  300  3e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.44 
 
 		 363 aa  300  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  48.57 
 
 		 325 aa  299  5e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0298  KpsF/GutQ family sugar isomerase  47.47 
 
 		 322 aa  298  6e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  47.95 
 
 		 333 aa  298  6e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  47.63 
 
 		 330 aa  298  8e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  46.98 
 
 		 325 aa  298  8e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.44 
 
 		 328 aa  298  8e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  44.59 
 
 		 325 aa  298  8e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0335  KpsF/GutQ family protein  47.28 
 
 		 334 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00223142  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0213  KpsF/GutQ  47.47 
 
 		 320 aa  298  1e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  46.37 
 
 		 327 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  48.88 
 
 		 325 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  47.77 
 
 		 326 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  46.37 
 
 		 327 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  46.06 
 
 		 323 aa  297  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  50.16 
 
 		 325 aa  297  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  48.56 
 
 		 325 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.79 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  48.56 
 
 		 325 aa  296  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  48.24 
 
 		 325 aa  296  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  46.82 
 
 		 324 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  46.06 
 
 		 326 aa  295  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  48.88 
 
 		 325 aa  295  7e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  50.16 
 
 		 325 aa  295  9e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12348  Sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  47.47 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0776  KpsF/GutQ family protein  44.94 
 
 		 324 aa  294  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  47.13 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  46.42 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2808  KpsF/GutQ family protein  43.95 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  49.37 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  47.77 
 
 		 323 aa  293  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0712  KpsF/GutQ family protein  48.88 
 
 		 325 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0114298 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3663  KpsF/GutQ family protein  48.88 
 
 		 325 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000627199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0721  KpsF/GutQ family protein  48.88 
 
 		 325 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0691  KpsF/GutQ family protein  48.88 
 
 		 325 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.983087  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  49.21 
 
 		 325 aa  291  7e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5962  KpsF/GutQ family protein  46.01 
 
 		 322 aa  291  8e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.28 
 
 		 328 aa  291  9e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.28 
 
 		 328 aa  291  9e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  47.28 
 
 		 328 aa  291  9e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.28 
 
 		 328 aa  291  9e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.28 
 
 		 328 aa  291  9e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.28 
 
 		 328 aa  291  9e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.28 
 
 		 328 aa  291  9e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>