More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0368 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  85.38 
 
 		 425 aa  763    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  81.56 
 
 		 423 aa  716    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 425 aa  876    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  65.4 
 
 		 435 aa  581  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  66.28 
 
 		 435 aa  579  1e-164  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  65.25 
 
 		 424 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  64.54 
 
 		 424 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  62.74 
 
 		 422 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  61.7 
 
 		 424 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  62 
 
 		 436 aa  547  1e-154  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 424 aa  542  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 424 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 424 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 424 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 424 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 424 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 424 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  60.76 
 
 		 424 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  62.17 
 
 		 423 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 424 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 424 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  60.28 
 
 		 424 aa  538  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  61.47 
 
 		 424 aa  538  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0440  seryl-tRNA synthetase  60.84 
 
 		 439 aa  533  1e-150  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  59.86 
 
 		 427 aa  531  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  61.87 
 
 		 423 aa  528  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  59.34 
 
 		 428 aa  524  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  58.87 
 
 		 423 aa  521  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 422 aa  518  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  58.51 
 
 		 421 aa  521  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 422 aa  518  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 422 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  59.34 
 
 		 422 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  57.92 
 
 		 427 aa  511  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 427 aa  509  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  59.67 
 
 		 422 aa  509  1e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  59.39 
 
 		 428 aa  511  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 422 aa  510  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 428 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  58.87 
 
 		 423 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 428 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  58.73 
 
 		 428 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  58.73 
 
 		 428 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  58.73 
 
 		 428 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  57.11 
 
 		 432 aa  501  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  56.78 
 
 		 428 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  58.16 
 
 		 424 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 428 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  56.54 
 
 		 428 aa  499  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  57.18 
 
 		 420 aa  499  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 423 aa  501  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 428 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 428 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 428 aa  498  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  57.78 
 
 		 428 aa  495  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  57.18 
 
 		 427 aa  496  1e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  58.87 
 
 		 423 aa  497  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 428 aa  495  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  56.84 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  57.48 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 423 aa  498  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  56.5 
 
 		 425 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  57.55 
 
 		 428 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1618  seryl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 427 aa  490  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.697706 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  58 
 
 		 423 aa  491  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  57.38 
 
 		 425 aa  489  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  56.98 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  56.15 
 
 		 429 aa  486  1e-136  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  56.81 
 
 		 427 aa  484  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  57.38 
 
 		 431 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  55.94 
 
 		 428 aa  488  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  56.67 
 
 		 432 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  57.11 
 
 		 430 aa  487  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  57.24 
 
 		 431 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1850  seryl-tRNA synthetase  56.05 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  57.04 
 
 		 425 aa  488  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 425 aa  486  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 430 aa  485  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00897  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 430 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 430 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  56.26 
 
 		 422 aa  484  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 430 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0968  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 430 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246515  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00904  hypothetical protein  56.74 
 
 		 430 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178726  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 433 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 430 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2227  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 430 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.495423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2479  seryl-tRNA synthetase  56.78 
 
 		 428 aa  482  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 433 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2703  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 430 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.48584  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 433 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 426 aa  482  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  56.26 
 
 		 425 aa  484  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  55.84 
 
 		 424 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 433 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 430 aa  482  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1077  seryl-tRNA synthetase  55.58 
 
 		 430 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1062  seryl-tRNA synthetase  55.81 
 
 		 430 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  56.28 
 
 		 433 aa  481  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 426 aa  480  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>