More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0431 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  100 
 
 
217 aa  449  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  93.09 
 
 
217 aa  423  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  88.94 
 
 
218 aa  407  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000024214  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3593  2-deoxyglucose-6-phosphatase  85.25 
 
 
218 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  84.79 
 
 
218 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4047  2-deoxyglucose-6-phosphatase  79.72 
 
 
219 aa  363  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000965281  normal  0.234971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3906  2-deoxyglucose-6-phosphatase  79.26 
 
 
219 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000443869  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3926  2-deoxyglucose-6-phosphatase  78.8 
 
 
219 aa  360  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  78.34 
 
 
219 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184484  hitchhiker  0.000000000456944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  60.83 
 
 
223 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  60.37 
 
 
222 aa  279  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0437  2-deoxyglucose-6-phosphatase  58.06 
 
 
221 aa  275  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000756317 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  60.45 
 
 
225 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  61.29 
 
 
221 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  59.02 
 
 
218 aa  262  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0284  2-deoxyglucose-6-phosphatase  57.14 
 
 
221 aa  261  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458991 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1912  2-deoxyglucose-6-phosphatase  47.62 
 
 
223 aa  209  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1419  2-deoxyglucose-6-phosphatase  45.79 
 
 
222 aa  207  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  hitchhiker  0.00259415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2022  2-deoxyglucose-6-phosphatase  45.79 
 
 
222 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  45.79 
 
 
222 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.905236  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  45.79 
 
 
222 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0029739  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1451  2-deoxyglucose-6-phosphatase  45.79 
 
 
222 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.913842  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1947  2-deoxyglucose-6-phosphatase  44.39 
 
 
222 aa  205  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2445  2-deoxyglucose-6-phosphatase  44.39 
 
 
222 aa  205  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1464  2-deoxyglucose-6-phosphatase  44.39 
 
 
222 aa  205  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1972  2-deoxyglucose-6-phosphatase  44.39 
 
 
222 aa  205  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01696  predicted hydrolase  44.39 
 
 
222 aa  204  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.39 
 
 
222 aa  204  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.752357  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01684  hypothetical protein  44.39 
 
 
222 aa  204  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  44.39 
 
 
222 aa  204  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.305682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1905  2-deoxyglucose-6-phosphatase  44.39 
 
 
222 aa  204  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.798501  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  45.5 
 
 
221 aa  200  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.5 
 
 
217 aa  198  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.022243  hitchhiker  0.00896914 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1697  2-deoxyglucose-6-phosphatase  46.05 
 
 
221 aa  194  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  46.05 
 
 
221 aa  194  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.417032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2125  2-deoxyglucose-6-phosphatase  45.54 
 
 
221 aa  194  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0177126  hitchhiker  0.00144451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1717  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.06 
 
 
223 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  40.09 
 
 
220 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  41.8 
 
 
218 aa  168  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  38.54 
 
 
221 aa  151  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.1 
 
 
226 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281035  normal  0.462582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.44 
 
 
224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0674  phosphatase  36.97 
 
 
215 aa  143  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  36.04 
 
 
213 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  33.67 
 
 
221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.01 
 
 
217 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.94 
 
 
238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  37.37 
 
 
227 aa  111  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.41 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.56873  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  30.57 
 
 
226 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  35.38 
 
 
221 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13910  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  33.88 
 
 
232 aa  102  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.491881  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.95 
 
 
218 aa  101  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4356  HAD family hydrolase  34.62 
 
 
233 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.582602 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.57 
 
 
217 aa  100  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.57 
 
 
213 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39300  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  29.86 
 
 
218 aa  99.4  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27350  HAD-superfamily hydrolase  32.24 
 
 
229 aa  99  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  30.66 
 
 
248 aa  98.6  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  34.41 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  34.74 
 
 
286 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.78 
 
 
229 aa  96.7  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  28.38 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  31.72 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  30.11 
 
 
221 aa  95.5  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  34.04 
 
 
228 aa  95.1  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  32.99 
 
 
219 aa  95.1  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3972  HAD family hydrolase  32.42 
 
 
241 aa  95.1  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.43 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  32.97 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  31.22 
 
 
396 aa  93.6  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  32.97 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1853  HAD family hydrolase  33.85 
 
 
235 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147437  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.61 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  31.89 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3605  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.04 
 
 
216 aa  92.8  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  31.89 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  31.89 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  31.89 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  31.89 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  34.04 
 
 
256 aa  92.8  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  31.89 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  31.89 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  32.97 
 
 
188 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  32.97 
 
 
188 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
456 aa  92.4  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4073  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.98 
 
 
219 aa  92.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.358464  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.45 
 
 
222 aa  92.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1175  HAD family hydrolase  36.22 
 
 
263 aa  92.4  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  32.97 
 
 
269 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.53 
 
 
219 aa  92.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  29.1 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  30.73 
 
 
456 aa  91.7  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2787  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.18 
 
 
230 aa  91.7  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  hitchhiker  0.0000132599 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  32.32 
 
 
222 aa  92  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.35 
 
 
224 aa  91.3  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1824  HAD family hydrolase  34.13 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1197  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.35 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal  0.148864 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.89 
 
 
188 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  29.27 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>