221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1916 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  62.19 
 
 
203 aa  262  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  62.19 
 
 
203 aa  262  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.77 
 
 
203 aa  207  8e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3843  hypothetical protein  48.28 
 
 
203 aa  201  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000198663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  47.78 
 
 
203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5171  hypothetical protein  47.29 
 
 
203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000552892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5500  hypothetical protein  47.78 
 
 
203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000371904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5565  hypothetical protein  47.29 
 
 
203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000029994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5413  hypothetical protein  47.29 
 
 
203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.81917e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5005  flavin reductase  47.29 
 
 
203 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000501887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5021  flavin reductase  47.29 
 
 
203 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000378469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5120  putative flavin reductase  46.8 
 
 
203 aa  194  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  46.31 
 
 
203 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5444  hypothetical protein  46.31 
 
 
203 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0364  nitrilotriacetate monooxygenase component B  46.63 
 
 
205 aa  184  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0075  hypothetical protein  44.06 
 
 
196 aa  159  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  37.24 
 
 
209 aa  153  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  38.58 
 
 
203 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  37.44 
 
 
203 aa  145  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2920  hypothetical protein  40.39 
 
 
202 aa  145  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  36.5 
 
 
200 aa  142  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  37.44 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  35.2 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  37.37 
 
 
207 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.68 
 
 
294 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.68 
 
 
196 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  38.38 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  32.82 
 
 
202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  36.18 
 
 
196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  35.98 
 
 
195 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  38.19 
 
 
204 aa  132  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.94 
 
 
223 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  39.13 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  38.59 
 
 
201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  38.59 
 
 
201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  38.17 
 
 
208 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  36.92 
 
 
219 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  35.75 
 
 
220 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  38.04 
 
 
201 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  35.94 
 
 
220 aa  127  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.3 
 
 
295 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  37 
 
 
292 aa  125  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  36.41 
 
 
241 aa  125  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  37.1 
 
 
207 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  36.08 
 
 
221 aa  125  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.95 
 
 
216 aa  124  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.07 
 
 
203 aa  124  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  37.06 
 
 
291 aa  124  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.91 
 
 
217 aa  123  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  36.56 
 
 
207 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  32.46 
 
 
211 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  34.38 
 
 
213 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  33.17 
 
 
216 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.16 
 
 
206 aa  122  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  32.11 
 
 
206 aa  122  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4410  hypothetical protein  33.68 
 
 
209 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  38.42 
 
 
210 aa  121  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.44 
 
 
203 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  36.56 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  34.72 
 
 
210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  32.98 
 
 
205 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78913  flavoprotein oxygenase  36.87 
 
 
287 aa  118  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  32.98 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02124  hypothetical protein  35.8 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  34.74 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  35.67 
 
 
205 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  35.48 
 
 
230 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  36.2 
 
 
208 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  34.59 
 
 
206 aa  116  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5124  flavin reductase-like, FMN-binding  34.01 
 
 
216 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.178532 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  31.69 
 
 
201 aa  114  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  32.79 
 
 
203 aa  114  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  32.79 
 
 
203 aa  114  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  31.67 
 
 
194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.95 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5786  hypothetical protein  32.49 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756136  hitchhiker  0.00296108 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  34.38 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  31.55 
 
 
220 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  33.51 
 
 
210 aa  112  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  34.95 
 
 
205 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  31.98 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  34.22 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  34.88 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  31.15 
 
 
201 aa  109  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  32.46 
 
 
205 aa  108  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  31.67 
 
 
194 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  33.94 
 
 
207 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.12 
 
 
294 aa  107  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  31.98 
 
 
221 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  32.61 
 
 
209 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  31.69 
 
 
203 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  28.64 
 
 
209 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  33.72 
 
 
209 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.72 
 
 
209 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  29.13 
 
 
228 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  33.72 
 
 
209 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  33.72 
 
 
209 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  32.46 
 
 
212 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>