More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2242 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  754    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  46.95 
 
 		 374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  48.68 
 
 		 376 aa  329  6e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  46.13 
 
 		 374 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3417  monooxygenase, FAD-binding  47.38 
 
 		 379 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  41.58 
 
 		 376 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  45.83 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  40.21 
 
 		 376 aa  294  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  42.29 
 
 		 371 aa  283  4.0000000000000003e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  39.89 
 
 		 376 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  43.88 
 
 		 373 aa  269  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  37.7 
 
 		 376 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  39.1 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  36.58 
 
 		 376 aa  256  5e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  39.15 
 
 		 399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  39.94 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  35.88 
 
 		 361 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  35.23 
 
 		 374 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  30.43 
 
 		 369 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  30.43 
 
 		 369 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  32.96 
 
 		 377 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  32.19 
 
 		 378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  31.62 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  36.45 
 
 		 369 aa  143  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  35.54 
 
 		 408 aa  142  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  26.84 
 
 		 377 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  30.2 
 
 		 374 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  32.75 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  32.15 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  34.32 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  31.25 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  26.82 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  32.3 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  26.9 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  26.82 
 
 		 377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  29.41 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 		 373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  33.99 
 
 		 404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  26.97 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  31.25 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  26.69 
 
 		 368 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  31.9 
 
 		 408 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  30.45 
 
 		 408 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  29.3 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  32.51 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  28.82 
 
 		 390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  28.53 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  30.59 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  30 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  30.55 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  29.32 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  29.34 
 
 		 402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  29.26 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  30.59 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  27.46 
 
 		 384 aa  113  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  29.94 
 
 		 412 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3614  monooxygenase FAD-binding  30.99 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392094  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7785  FAD-dependent oxidoreductase  29.87 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  29.71 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  30.91 
 
 		 402 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  28.37 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  31.49 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  28.17 
 
 		 376 aa  110  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  31.42 
 
 		 388 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  30.84 
 
 		 413 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  32.87 
 
 		 392 aa  109  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  30.81 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  29.24 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  32.69 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  31.56 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  30.65 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  30.25 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  32.17 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  30.58 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.01 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.58 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  30.4 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  28.96 
 
 		 390 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  30.57 
 
 		 389 aa  106  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 367 aa  106  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  29.78 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  33.06 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  33.52 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  26.69 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8535  monooxygenase FAD-binding  29.33 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.0015439 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  31.13 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  30.77 
 
 		 404 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  28.92 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  28.49 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  30.28 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  30.1 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  29.29 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  29.23 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  30.85 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  29.23 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  26.69 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  28.94 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  29.41 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  29.41 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.99121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>