87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0592 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  260  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  60 
 
 		 129 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  57.76 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  54.55 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  46.97 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  57.94 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  54.39 
 
 		 131 aa  110  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  52.17 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  47.79 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  50.88 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  52.25 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  49.54 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  52.94 
 
 		 386 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  47.58 
 
 		 132 aa  107  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  43.48 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  47.11 
 
 		 386 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  45.05 
 
 		 118 aa  102  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  48.78 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  49.12 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  33.9 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  38.26 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  74.24 
 
 		 75 aa  96.3  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  47.79 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  52.78 
 
 		 126 aa  95.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  46.22 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  44.72 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  47.46 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0560  hypothetical protein  62.77 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  49.17 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  45.38 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  34 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1449  hypothetical protein  66.67 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.808576  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  41.38 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  44.44 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3301  hypothetical protein  55.05 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2654  protein of unknown function DUF1232  54.13 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140494  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  44.29 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  41.77 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  40.66 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  39.56 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  38.82 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  46 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  37.08 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  39.24 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  37.84 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  42.03 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  43.94 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  35.82 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0363  hypothetical protein  40.58 
 
 		 80 aa  50.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  38.27 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  43.08 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  36.47 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  37.04 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  38.98 
 
 		 249 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  36.17 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  36.21 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  37.5 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  37.5 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  36.17 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  37.36 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  30.77 
 
 		 124 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2613  hypothetical protein  40.38 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  32.81 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  31.13 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  34.69 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  30.21 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  34.69 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  36.71 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1038  hypothetical protein  47.62 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  34.69 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  34.57 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  34.69 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4573  hypothetical protein  34.43 
 
 		 99 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  37.31 
 
 		 182 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  34.83 
 
 		 116 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  60 
 
 		 95 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  34.38 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  40.43 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  34.38 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  37.66 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  39.13 
 
 		 135 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  34.29 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0661  hypothetical protein  37.04 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>