139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0274 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  100 
 
 
392 aa  791  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  69.97 
 
 
393 aa  573  1e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  54.95 
 
 
408 aa  398  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  50.62 
 
 
392 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  50.12 
 
 
399 aa  379  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  41.44 
 
 
397 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  37.11 
 
 
398 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  38.32 
 
 
416 aa  236  6e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  39.19 
 
 
412 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  36.29 
 
 
395 aa  212  9e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  32.07 
 
 
406 aa  203  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  32.06 
 
 
406 aa  201  2e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  32.43 
 
 
407 aa  200  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  34.73 
 
 
409 aa  180  5e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  30.93 
 
 
420 aa  174  2e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  30.9 
 
 
444 aa  173  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  33.53 
 
 
440 aa  169  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  33.14 
 
 
414 aa  166  7e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  32.82 
 
 
408 aa  166  7e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  33.14 
 
 
414 aa  164  2e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  31.02 
 
 
424 aa  160  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  30 
 
 
389 aa  155  1e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  5.55494e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  28.17 
 
 
413 aa  152  9e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.75865e-11 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  29.41 
 
 
421 aa  152  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  29.59 
 
 
404 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  27.91 
 
 
413 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  27.91 
 
 
413 aa  149  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  1.36411e-08 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  28.12 
 
 
390 aa  149  9e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  32.49 
 
 
434 aa  142  1e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  27.88 
 
 
425 aa  141  2e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  27.88 
 
 
425 aa  141  2e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  27.88 
 
 
425 aa  141  2e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  29.81 
 
 
417 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  28.49 
 
 
426 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  27.58 
 
 
445 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  6.93474e-09 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  27.91 
 
 
401 aa  131  2e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  28.69 
 
 
524 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  25.87 
 
 
412 aa  129  8e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  26.91 
 
 
544 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  28.21 
 
 
411 aa  127  4e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  27.55 
 
 
416 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  27.63 
 
 
431 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  6.49364e-05 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  26.51 
 
 
384 aa  121  2e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  27.53 
 
 
444 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  29.94 
 
 
407 aa  117  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  27.22 
 
 
408 aa  117  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  28.38 
 
 
420 aa  116  8e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  25.72 
 
 
423 aa  115  9e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  27.98 
 
 
460 aa  114  4e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  28.14 
 
 
417 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  24.2 
 
 
436 aa  112  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  27.08 
 
 
407 aa  112  1e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  25.38 
 
 
455 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  24.52 
 
 
419 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  27.2 
 
 
429 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  26.52 
 
 
473 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  26.14 
 
 
455 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  26.18 
 
 
411 aa  106  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  27.84 
 
 
428 aa  106  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  28.83 
 
 
457 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  28.92 
 
 
429 aa  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  31.02 
 
 
833 aa  103  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  31.82 
 
 
833 aa  102  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  6.39413e-05 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  27.97 
 
 
428 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  31.02 
 
 
859 aa  102  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  1.40812e-05 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  26.87 
 
 
434 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  6.79414e-05 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  26.3 
 
 
433 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.6128e-12 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  27.63 
 
 
435 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  31.73 
 
 
415 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  23.5 
 
 
445 aa  97.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  23.25 
 
 
445 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 
454 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 
454 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  24.68 
 
 
448 aa  95.1  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  27.07 
 
 
434 aa  94  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  27.48 
 
 
447 aa  94  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  23.91 
 
 
409 aa  93.6  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  26.46 
 
 
416 aa  93.2  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  26.46 
 
 
416 aa  92.8  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  21.76 
 
 
436 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  21.76 
 
 
436 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  25.21 
 
 
441 aa  81.6  2e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  24.59 
 
 
420 aa  80.5  4e-14  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  23.68 
 
 
414 aa  79.7  7e-14  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1772  HK97 family phage portal protein  23.81 
 
 
451 aa  78.6  2e-13  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  26.05 
 
 
422 aa  78.2  2e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 
413 aa  76.6  6e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  24.65 
 
 
408 aa  76.6  7e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  27.61 
 
 
391 aa  75.1  2e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  26.82 
 
 
391 aa  74.7  3e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  23.35 
 
 
404 aa  74.7  3e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1966  Phage portal protein, HK97  28.13 
 
 
391 aa  74.3  3e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2901  HK97 family phage portal protein  25.77 
 
 
400 aa  74.7  3e-12  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149993  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4384  phage portal protein, HK97 family  23.32 
 
 
264 aa  74.3  3e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2959  phage portal protein, HK97 family  23.44 
 
 
415 aa  74.3  4e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  24.6 
 
 
542 aa  73.6  6e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  27.09 
 
 
391 aa  73.2  7e-12  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  23.55 
 
 
408 aa  73.2  8e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  25.85 
 
 
464 aa  72.8  9e-12  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  24.35 
 
 
401 aa  72.4  1e-11  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0489201 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>