82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1358 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  100 
 
 
171 aa  336  7e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  86.75 
 
 
168 aa  287  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  47.88 
 
 
165 aa  142  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  51.43 
 
 
165 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  45.73 
 
 
167 aa  128  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  38.92 
 
 
183 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  44.06 
 
 
165 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  44.06 
 
 
165 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  41.73 
 
 
144 aa  93.6  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  38.41 
 
 
231 aa  92.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  36.48 
 
 
177 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  36.48 
 
 
177 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  35.92 
 
 
240 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  39.61 
 
 
219 aa  87.8  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  38.67 
 
 
220 aa  87.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  41.38 
 
 
222 aa  87  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  41.38 
 
 
222 aa  87  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  36.71 
 
 
235 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  40.65 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  39.13 
 
 
215 aa  84.3  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  34.93 
 
 
190 aa  84.3  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  40.29 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  30.67 
 
 
174 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  41.54 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  36.08 
 
 
240 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  37.59 
 
 
248 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  33.79 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  37.16 
 
 
205 aa  80.9  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  40.74 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  40.3 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  40.74 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  32.64 
 
 
216 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  32.64 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  35.12 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  32.08 
 
 
228 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  38.93 
 
 
186 aa  77  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  35.71 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  39.37 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  30.46 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  46.53 
 
 
139 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  32.47 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  30.18 
 
 
177 aa  72  0.000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  35.71 
 
 
371 aa  72  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  31.47 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  30.26 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  30.72 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  33.33 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  32.05 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  32.54 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  32.54 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1717  prohead protease  32.33 
 
 
525 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155167  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  34.67 
 
 
250 aa  64.7  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  31.43 
 
 
248 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  39.42 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  37.59 
 
 
150 aa  63.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  35.04 
 
 
645 aa  62  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  35.04 
 
 
645 aa  62  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  35.04 
 
 
645 aa  62  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  31.29 
 
 
228 aa  61.2  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  29.86 
 
 
233 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  30.46 
 
 
236 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  33.96 
 
 
649 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  33.53 
 
 
526 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  33.14 
 
 
526 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  34.09 
 
 
149 aa  58.9  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  33.14 
 
 
526 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  33.6 
 
 
579 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  32.48 
 
 
659 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  33.58 
 
 
646 aa  55.5  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  31.75 
 
 
661 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  31.75 
 
 
661 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  31.21 
 
 
659 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  50 
 
 
420 aa  51.2  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1641  prohead protease  25.35 
 
 
197 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.627569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  31.52 
 
 
213 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  27.7 
 
 
169 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0566  peptidase U35 phage prohead HK97  32 
 
 
218 aa  44.7  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0319239  hitchhiker  0.0000000000000124993 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0239  peptidase U35 phage prohead HK97  29.45 
 
 
206 aa  44.3  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  34.38 
 
 
600 aa  42.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2687  peptidase U35 phage prohead HK97  29.45 
 
 
409 aa  40.8  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  32.04 
 
 
612 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  25.17 
 
 
186 aa  40.8  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>