125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0023 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0023  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0033  hypothetical protein  92.31 
 
 		 208 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1365  hypothetical protein  91.83 
 
 		 208 aa  334  5e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  75 
 
 		 210 aa  289  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0027  hypothetical protein  68.27 
 
 		 208 aa  286  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3340  hypothetical protein  74.04 
 
 		 207 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  56.28 
 
 		 204 aa  207  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  49.75 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  49.5 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  48.77 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4043  hypothetical protein  44.86 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  43.63 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3073  hypothetical protein  54.84 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2296  hypothetical protein  46.46 
 
 		 181 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0878915  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  42.29 
 
 		 186 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  42.71 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3587  hypothetical protein  45.85 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.492046  normal  0.202587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3880  hypothetical protein  46.83 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0764274 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  40 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2628  hypothetical protein  37.86 
 
 		 219 aa  122  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2557  hypothetical protein  46.19 
 
 		 212 aa  121  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216899  normal  0.863189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  36 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  38.46 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0050  hypothetical protein  39.49 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00342  hypothetical protein  35.59 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002094  putative preQ0 transporter  35.59 
 
 		 245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3755  hypothetical protein  39.18 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  37.24 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4791  hypothetical protein  39.18 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  37.44 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2279  hypothetical protein  36.19 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0191  hypothetical protein  37.2 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0013  hypothetical protein  40.51 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  37.44 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  37.44 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000681461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  37.44 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00140  hypothetical protein  39.49 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  37.44 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  37.44 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000298941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  37.44 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3771  hypothetical protein  37.44 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0226  hypothetical protein  35.91 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  37.44 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000918531  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03320  conserved inner membrane protein  38.66 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0244  conserved hypothetical protein  38.66 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3670  hypothetical protein  38.66 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3953  hypothetical protein  38.66 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  36.92 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  35.9 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3851  hypothetical protein  38.66 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3848  hypothetical protein  37.44 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3891  hypothetical protein  37.44 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3781  hypothetical protein  36.45 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3951  hypothetical protein  36.45 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03273  hypothetical protein  38.66 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  37.44 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0245  hypothetical protein  38.78 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0091  hypothetical protein  34.76 
 
 		 225 aa  111  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0214  hypothetical protein  35.29 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0204  hypothetical protein  36.92 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2235  hypothetical protein  38.58 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3878  hypothetical protein  37.95 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0922175 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0086  hypothetical protein  34.29 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.106131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2745  hypothetical protein  37.56 
 
 		 222 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0268522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0231  hypothetical protein  36.92 
 
 		 222 aa  107  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3987  hypothetical protein  36.92 
 
 		 222 aa  107  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0569  hypothetical protein  36.92 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1936  hypothetical protein  37.44 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4070  hypothetical protein  35.15 
 
 		 222 aa  101  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3883  hypothetical protein  33.49 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0305  hypothetical protein  35.05 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0322  hypothetical protein  35.2 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0541  hypothetical protein  32.88 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  31.4 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  31.4 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  30.37 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  28.57 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  30.71 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  26.88 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12650  hypothetical protein  24.68 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  29.71 
 
 		 235 aa  52.8  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  30.83 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  31.11 
 
 		 262 aa  53.1  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  27.92 
 
 		 289 aa  51.6  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  35.86 
 
 		 235 aa  51.6  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  27.32 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  28.77 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  31.45 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  31.85 
 
 		 235 aa  48.9  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  33.58 
 
 		 228 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4196  hypothetical protein  27.13 
 
 		 298 aa  48.5  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0431  hypothetical protein  31.3 
 
 		 245 aa  48.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  29.05 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  29.05 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  29.49 
 
 		 266 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0376  hypothetical protein  29.45 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.012139 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  34.53 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  33.58 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1637  hypothetical protein  30.16 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  26.83 
 
 		 289 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>