More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3096 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
439 aa  862    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  54.89 
 
 
417 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  51.4 
 
 
409 aa  345  8e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  41.6 
 
 
409 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  39.53 
 
 
417 aa  236  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  40.9 
 
 
388 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  38.82 
 
 
411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  35.59 
 
 
415 aa  219  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2071  glycosyl transferase, group 1  40.2 
 
 
391 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637859  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  37.95 
 
 
425 aa  189  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  36.75 
 
 
413 aa  184  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.79 
 
 
378 aa  183  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  33.41 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 
398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.85 
 
 
401 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
394 aa  141  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  30.31 
 
 
386 aa  130  6e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 
421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 
409 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
401 aa  127  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 
360 aa  126  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
396 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
455 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
403 aa  122  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0579  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 
367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  37.81 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 
395 aa  117  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
410 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  36.77 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
397 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  35.74 
 
 
395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  29.62 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
422 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1166  glycosyl transferase group 1  35.52 
 
 
370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.27899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
389 aa  109  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 
398 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
391 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  34.36 
 
 
383 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
381 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  32.1 
 
 
425 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
381 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
414 aa  107  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
394 aa  107  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  23.02 
 
 
360 aa  107  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 
371 aa  107  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
408 aa  106  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
360 aa  106  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
373 aa  106  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 
422 aa  106  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
411 aa  106  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  27.3 
 
 
650 aa  106  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 
404 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 
420 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 
420 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  21.77 
 
 
364 aa  105  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  27.58 
 
 
406 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
394 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 
390 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
426 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
399 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  23.1 
 
 
358 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
385 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 
405 aa  104  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 
369 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
381 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0569  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
394 aa  104  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 
405 aa  103  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  28.6 
 
 
414 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
422 aa  103  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  36.22 
 
 
436 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
365 aa  103  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
402 aa  103  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.48 
 
 
381 aa  103  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 
370 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  29.58 
 
 
423 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
406 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 
416 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  35.82 
 
 
397 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
424 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  33.44 
 
 
417 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 
454 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.66 
 
 
381 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.48 
 
 
381 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  36.7 
 
 
480 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.48 
 
 
381 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  25.48 
 
 
381 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.48 
 
 
381 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  37.76 
 
 
386 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  30.4 
 
 
394 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  25.48 
 
 
381 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>