282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1122 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 325 aa  649    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  50.97 
 
 		 325 aa  285  9e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  49.04 
 
 		 332 aa  277  1e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  48.73 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  44.48 
 
 		 335 aa  275  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  47.48 
 
 		 362 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  44.34 
 
 		 354 aa  269  4e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  50.32 
 
 		 329 aa  264  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  45.63 
 
 		 361 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  48.71 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  45.42 
 
 		 351 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  45.42 
 
 		 324 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  46.41 
 
 		 353 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 		 353 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  45.16 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  44.03 
 
 		 358 aa  250  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  45.16 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  45.02 
 
 		 334 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  47.08 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  45.81 
 
 		 330 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  44.16 
 
 		 330 aa  245  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  45.48 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  44.88 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  42.09 
 
 		 336 aa  241  9e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  45.31 
 
 		 353 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  43.18 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  44.98 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  44.16 
 
 		 352 aa  233  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  45.52 
 
 		 353 aa  225  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  44.23 
 
 		 353 aa  222  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  42.07 
 
 		 357 aa  215  5.9999999999999996e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  44 
 
 		 332 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  41.03 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  39.35 
 
 		 324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  38.91 
 
 		 423 aa  198  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  42.86 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  38.63 
 
 		 324 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  38.63 
 
 		 324 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  38.63 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  38.63 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  38.63 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  38.63 
 
 		 324 aa  195  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  37.91 
 
 		 324 aa  195  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  37.91 
 
 		 324 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  37.55 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  37.58 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  40.15 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  38.8 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  38.8 
 
 		 329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  38.8 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  35.69 
 
 		 364 aa  179  8e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  39.69 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  42.55 
 
 		 358 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  39.24 
 
 		 358 aa  176  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  44.94 
 
 		 374 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  40.85 
 
 		 374 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  38.21 
 
 		 364 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  36.48 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  36.86 
 
 		 362 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  39.5 
 
 		 374 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  36.14 
 
 		 356 aa  168  9e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  39.33 
 
 		 383 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.57 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  35.49 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  43.72 
 
 		 374 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  38.11 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  37.99 
 
 		 358 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  38.87 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  37.94 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  43.32 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.66 
 
 		 374 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  43.72 
 
 		 376 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  38.66 
 
 		 374 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  38.66 
 
 		 374 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  34.43 
 
 		 376 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  37.2 
 
 		 367 aa  163  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  40.8 
 
 		 363 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  40.75 
 
 		 362 aa  162  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0514  outer membrane protein  36.33 
 
 		 398 aa  162  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  41.13 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  35.95 
 
 		 350 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  37.88 
 
 		 318 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  37.82 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  40 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  40.18 
 
 		 357 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03132  Zn-dependent hydrolase/oxidoreductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13010)  32.62 
 
 		 414 aa  156  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.131518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  38.28 
 
 		 381 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  38.19 
 
 		 372 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  38.19 
 
 		 372 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  38.19 
 
 		 372 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  39.73 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  41.91 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  40.49 
 
 		 386 aa  153  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.42 
 
 		 353 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  39.82 
 
 		 366 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  38.15 
 
 		 388 aa  149  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  38.31 
 
 		 372 aa  149  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  38.66 
 
 		 372 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  38.21 
 
 		 396 aa  149  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5524  hypothetical protein  31.99 
 
 		 330 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608927  normal  0.76442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>