62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0151 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0151  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  482  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2700  hypothetical protein  45.24 
 
 		 224 aa  101  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1801  hypothetical protein  41.84 
 
 		 185 aa  98.6  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0290  hypothetical protein  41.67 
 
 		 185 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5284  protein of unknown function DUF583  49.07 
 
 		 171 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0798  hypothetical protein  45.79 
 
 		 185 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal  0.0126197 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1225  protein of unknown function DUF583  45.83 
 
 		 189 aa  95.1  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0430  hypothetical protein  45.22 
 
 		 183 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3896  hypothetical protein  47.52 
 
 		 184 aa  92.8  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  40.82 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1347  hypothetical protein  46.85 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4081  hypothetical protein  47.47 
 
 		 186 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0579  protein of unknown function DUF583  46.53 
 
 		 184 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0600  hypothetical protein  46.53 
 
 		 184 aa  87.8  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.296784 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1308  protein of unknown function DUF583  37.7 
 
 		 162 aa  78.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.677275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2023  hypothetical protein  43.24 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  33.33 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  25.69 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  28.72 
 
 		 161 aa  53.5  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  28.12 
 
 		 131 aa  52  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  29.2 
 
 		 143 aa  52  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  28.07 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  28.42 
 
 		 115 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  29.2 
 
 		 139 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  31.13 
 
 		 138 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  35.06 
 
 		 113 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  26.15 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3691  hypothetical protein  31.93 
 
 		 178 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  30 
 
 		 131 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  24.35 
 
 		 160 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  22.48 
 
 		 158 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2201  hypothetical protein  32.95 
 
 		 109 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  29.21 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  26.35 
 
 		 154 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  25.81 
 
 		 149 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  22 
 
 		 196 aa  45.4  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  25.81 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  25.81 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  25.22 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  28.93 
 
 		 164 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  25 
 
 		 134 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  25.81 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  29.29 
 
 		 134 aa  44.3  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  23.85 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  26.61 
 
 		 153 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  23.08 
 
 		 148 aa  43.5  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  26.89 
 
 		 148 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  29.46 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  26.36 
 
 		 147 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  27.27 
 
 		 135 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  25.74 
 
 		 132 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  25.74 
 
 		 132 aa  42.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  22.73 
 
 		 137 aa  42.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  30.88 
 
 		 131 aa  42.4  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  26.05 
 
 		 148 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  24.47 
 
 		 282 aa  42.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  24.34 
 
 		 195 aa  42.4  0.008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3571  hypothetical protein  25.93 
 
 		 137 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.885538  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  26.44 
 
 		 262 aa  42  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  26.44 
 
 		 262 aa  42  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  26 
 
 		 134 aa  42  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>