More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0050 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  100 
 
 
316 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  84.54 
 
 
314 aa  506  1e-142  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  83.23 
 
 
317 aa  505  1e-142  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  79.14 
 
 
332 aa  494  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  81.45 
 
 
317 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  77.3 
 
 
333 aa  484  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.32 
 
 
336 aa  453  1e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  74.61 
 
 
282 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  72.48 
 
 
289 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  72.65 
 
 
310 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  72.41 
 
 
283 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  72.16 
 
 
289 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  74.02 
 
 
282 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  71.6 
 
 
290 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  67.92 
 
 
311 aa  362  4e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  66.04 
 
 
279 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  72.15 
 
 
254 aa  360  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  68.06 
 
 
321 aa  360  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  72.15 
 
 
277 aa  359  3e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  71.31 
 
 
268 aa  357  1e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  67.18 
 
 
258 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  70.63 
 
 
267 aa  354  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  70.16 
 
 
261 aa  353  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  66.8 
 
 
258 aa  352  3e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  67.06 
 
 
264 aa  350  2e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  70.46 
 
 
270 aa  346  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  66.8 
 
 
263 aa  345  7e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  66.8 
 
 
264 aa  325  6e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  63.03 
 
 
256 aa  323  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0106  ABC transporter related  65.96 
 
 
253 aa  323  2e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.995719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  59.38 
 
 
288 aa  323  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  64.56 
 
 
267 aa  315  7e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  61.81 
 
 
258 aa  314  1e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  60.84 
 
 
271 aa  312  4e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  60.32 
 
 
249 aa  310  3e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  61.94 
 
 
268 aa  306  4e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  60 
 
 
252 aa  305  5e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  59.69 
 
 
265 aa  303  2e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  58.37 
 
 
262 aa  303  2e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  58.37 
 
 
262 aa  303  2e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  62.04 
 
 
268 aa  303  3e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  59.84 
 
 
264 aa  301  9e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  62.03 
 
 
254 aa  300  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  62.03 
 
 
244 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  59.11 
 
 
264 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  59.83 
 
 
240 aa  300  3e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  59.17 
 
 
244 aa  300  3e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  61.51 
 
 
253 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  60.16 
 
 
262 aa  299  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  60.74 
 
 
263 aa  299  5e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  58.96 
 
 
262 aa  298  8e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  61.09 
 
 
253 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  61.09 
 
 
253 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  56.54 
 
 
268 aa  297  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  59.35 
 
 
255 aa  297  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  60.32 
 
 
251 aa  297  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  60.83 
 
 
241 aa  296  3e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  60.83 
 
 
241 aa  296  3e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  59.59 
 
 
241 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  60.33 
 
 
255 aa  294  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  57.92 
 
 
241 aa  294  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  57.36 
 
 
258 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  57.2 
 
 
258 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 
241 aa  293  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  59.07 
 
 
244 aa  293  3e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  57.92 
 
 
241 aa  292  4e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  57.08 
 
 
244 aa  292  5e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  56.98 
 
 
258 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  55.77 
 
 
261 aa  291  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  56.76 
 
 
263 aa  291  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  57.74 
 
 
240 aa  291  8e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  56.2 
 
 
258 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  56.2 
 
 
258 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  56.2 
 
 
258 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  57.48 
 
 
266 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  56.2 
 
 
258 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  56.2 
 
 
258 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  56.2 
 
 
258 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  56.2 
 
 
258 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  57.6 
 
 
256 aa  290  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  56.9 
 
 
244 aa  290  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  56.72 
 
 
241 aa  290  3e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  56.2 
 
 
258 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  56.2 
 
 
258 aa  289  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  55 
 
 
261 aa  289  5e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  56.2 
 
 
258 aa  288  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  56.54 
 
 
244 aa  288  7e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  56.64 
 
 
260 aa  288  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  60.5 
 
 
247 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  58.16 
 
 
244 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  55.81 
 
 
258 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  55.81 
 
 
258 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  59.5 
 
 
249 aa  286  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  57.14 
 
 
241 aa  286  3e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  58.58 
 
 
254 aa  286  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  58.4 
 
 
243 aa  285  5e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  57.5 
 
 
244 aa  285  6e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  56.73 
 
 
247 aa  285  6e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0336  ABC transporter related  60.57 
 
 
250 aa  285  7e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.18468  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0347  ABC transporter related  60.57 
 
 
255 aa  285  7e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>