66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1330 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  100 
 
 		 685 aa  1389    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  62.63 
 
 		 691 aa  875    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  51.18 
 
 		 728 aa  643    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  95.59 
 
 		 685 aa  1325    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  71.18 
 
 		 681 aa  949    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  50.89 
 
 		 728 aa  644    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  40.2 
 
 		 684 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  38.64 
 
 		 710 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  40.55 
 
 		 707 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  40.46 
 
 		 720 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  40.41 
 
 		 707 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  40.47 
 
 		 689 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1649  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  46.13 
 
 		 359 aa  310  6.999999999999999e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0249  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  43.21 
 
 		 370 aa  293  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00032725  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0173  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  44.57 
 
 		 357 aa  291  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696733  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0808  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  42.15 
 
 		 362 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000170863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0150  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  44.57 
 
 		 360 aa  276  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0129  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  42.16 
 
 		 371 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000445979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00730  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  41.39 
 
 		 362 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000274075  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0115  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.95 
 
 		 364 aa  249  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000323099  hitchhiker  0.00167749 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0114  hypothetical protein  34.52 
 
 		 302 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0358289  hitchhiker  0.00078389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0475  hypothetical protein  38.79 
 
 		 299 aa  189  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00720  hypothetical protein  32.91 
 
 		 305 aa  189  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000877673  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0149  hypothetical protein  36.22 
 
 		 300 aa  188  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0567257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2025  hypothetical protein  36.86 
 
 		 299 aa  185  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0375526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0587  hypothetical protein  32.57 
 
 		 303 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0873705  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2695  hypothetical protein  32.36 
 
 		 317 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1830  hypothetical protein  38.46 
 
 		 304 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.290615 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0112  hypothetical protein  32.36 
 
 		 304 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000282861  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0492  hypothetical protein  35.78 
 
 		 334 aa  176  9e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0807  hypothetical protein  32.62 
 
 		 302 aa  172  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00370253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3630  dehydrogenase-like protein  33.44 
 
 		 312 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.496684  normal  0.352042 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1511  hypothetical protein  35.36 
 
 		 301 aa  164  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.850305  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1254  protein of unknown function DUF205  35.33 
 
 		 574 aa  160  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0989  hypothetical protein  33.04 
 
 		 556 aa  135  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.39207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1012  hypothetical protein  33.53 
 
 		 560 aa  135  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262179  hitchhiker  0.000000557566 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  29.1 
 
 		 955 aa  125  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  30.42 
 
 		 845 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  26.23 
 
 		 891 aa  102  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2946  aminotransferase class-III  27.93 
 
 		 957 aa  99.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05891  dehydrogenase  26.75 
 
 		 346 aa  99.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0334693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5680  hypothetical protein  25.07 
 
 		 366 aa  97.4  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0387198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1864  dehydrogenase  26.44 
 
 		 346 aa  96.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2279  hypothetical protein  26.52 
 
 		 339 aa  94.4  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05971  dehydrogenase  27.41 
 
 		 346 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05891  dehydrogenase  26.48 
 
 		 346 aa  93.2  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.735878  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0399  hypothetical protein  25.81 
 
 		 340 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247515  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05591  dehydrogenase  26.48 
 
 		 346 aa  92.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2534  hypothetical protein  25.16 
 
 		 339 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0898  dehydrogenase-like protein  25.24 
 
 		 340 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0872  dehydrogenase like protein  25.24 
 
 		 340 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.76 
 
 		 339 aa  86.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121651  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1594  hypothetical protein  27.1 
 
 		 341 aa  87  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.293919 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0533  hypothetical protein  25.55 
 
 		 346 aa  86.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2782  pyridoxalphosphate dependent aminotransferase, class III  25.65 
 
 		 959 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2973  aminotransferase class-III  25.65 
 
 		 956 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05361  dehydrogenase  25.47 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1634  hypothetical protein  27.55 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.509196  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0729  hypothetical protein  26.93 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07811  hypothetical protein  27.96 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3031  amino acid adenylation domain protein  25 
 
 		 1466 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3090  amino acid adenylation domain protein  24.55 
 
 		 1466 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  33.94 
 
 		 260 aa  46.6  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.83 
 
 		 251 aa  44.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295469  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 255 aa  44.3  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1787  short chain dehydrogenase  42.03 
 
 		 258 aa  43.9  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>