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for query gene Rmar_1387 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1387  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 575 aa  1120    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000830538  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.37 
 
 		 523 aa  385  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.81 
 
 		 621 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.46 
 
 		 615 aa  351  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2674  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.31 
 
 		 684 aa  346  8e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1147  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.9 
 
 		 702 aa  330  4e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.624322  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.81 
 
 		 565 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.82 
 
 		 569 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014212  Mesil_2812  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.27 
 
 		 1102 aa  309  9e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.220309 
 
 
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NC_013946  Mrub_0144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.65 
 
 		 890 aa  306  5.0000000000000004e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000517573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  34.11 
 
 		 537 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  42.34 
 
 		 535 aa  300  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.02 
 
 		 666 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.54 
 
 		 678 aa  296  8e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.65 
 
 		 522 aa  289  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.43 
 
 		 528 aa  289  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.09 
 
 		 562 aa  288  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.43 
 
 		 513 aa  286  7e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.96 
 
 		 513 aa  286  7e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.43 
 
 		 513 aa  286  8e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_0662  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.88 
 
 		 525 aa  286  9e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.09 
 
 		 535 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.43 
 
 		 513 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.75 
 
 		 504 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
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NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.43 
 
 		 513 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.43 
 
 		 513 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  35.43 
 
 		 513 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  35.43 
 
 		 513 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.92 
 
 		 504 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.71 
 
 		 676 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.61 
 
 		 509 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.61 
 
 		 509 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.27 
 
 		 528 aa  282  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.86 
 
 		 509 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  40.56 
 
 		 515 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.61 
 
 		 504 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.77 
 
 		 685 aa  282  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.76 
 
 		 593 aa  282  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.36 
 
 		 513 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.36 
 
 		 513 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.6 
 
 		 697 aa  281  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
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NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.54 
 
 		 504 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.54 
 
 		 519 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.54 
 
 		 504 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.27 
 
 		 504 aa  280  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.97 
 
 		 511 aa  279  9e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.3 
 
 		 504 aa  279  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.3 
 
 		 504 aa  279  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.3 
 
 		 504 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.8 
 
 		 641 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.3 
 
 		 504 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.73 
 
 		 539 aa  276  6e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.31 
 
 		 509 aa  276  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
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NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.63 
 
 		 682 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.22 
 
 		 592 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.63 
 
 		 682 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.63 
 
 		 682 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
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NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.75 
 
 		 501 aa  273  9e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  34.74 
 
 		 1062 aa  273  9e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.24 
 
 		 558 aa  272  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.21 
 
 		 541 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.24 
 
 		 538 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.12 
 
 		 561 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.87 
 
 		 672 aa  270  5.9999999999999995e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  36.31 
 
 		 666 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.01 
 
 		 511 aa  269  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.18 
 
 		 685 aa  269  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.75 
 
 		 537 aa  268  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.34 
 
 		 511 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.51 
 
 		 523 aa  268  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.94 
 
 		 511 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  31.64 
 
 		 507 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.69 
 
 		 534 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  31.45 
 
 		 507 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.75 
 
 		 511 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.75 
 
 		 511 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  32.15 
 
 		 511 aa  267  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.48 
 
 		 539 aa  267  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.72 
 
 		 680 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  40.56 
 
 		 501 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.58 
 
 		 554 aa  266  8e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  32.15 
 
 		 511 aa  266  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.91 
 
 		 485 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.91 
 
 		 504 aa  265  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  41.57 
 
 		 520 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.34 
 
 		 504 aa  264  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.45 
 
 		 530 aa  263  8.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  36.98 
 
 		 537 aa  262  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  36.98 
 
 		 537 aa  262  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.74 
 
 		 525 aa  262  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.39 
 
 		 513 aa  262  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
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NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  40.32 
 
 		 539 aa  261  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
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NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.81 
 
 		 650 aa  261  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
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NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  38.79 
 
 		 535 aa  260  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.98 
 
 		 537 aa  260  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_0331  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.65 
 
 		 571 aa  259  8e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.92 
 
 		 537 aa  259  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  36.92 
 
 		 537 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
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NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.29 
 
 		 607 aa  259  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  36.92 
 
 		 537 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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