More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1367 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1367  peptidase C26  100 
 
 
239 aa  477  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  36.13 
 
 
602 aa  133  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  36.7 
 
 
244 aa  126  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  34.65 
 
 
231 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  39.17 
 
 
255 aa  125  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  36.29 
 
 
298 aa  122  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  38.14 
 
 
251 aa  122  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  38.46 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  39.32 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  44.83 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  32.02 
 
 
238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  31.03 
 
 
238 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  35.44 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  39.04 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  35.41 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  34.26 
 
 
250 aa  116  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  37.86 
 
 
240 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  34.78 
 
 
233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  33.04 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  34.33 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  40.17 
 
 
236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  40.17 
 
 
236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  40.17 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  36.95 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  31.94 
 
 
241 aa  112  6e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  31.34 
 
 
241 aa  111  8.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  32.08 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  36.6 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  32.81 
 
 
238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0121  peptidase C26  35.81 
 
 
255 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  35.07 
 
 
268 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3313  peptidase C26  37.67 
 
 
305 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3963  peptidase C26  37.67 
 
 
305 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0830128  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4597  peptidase C26  36.89 
 
 
307 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  36.18 
 
 
267 aa  105  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  40.31 
 
 
242 aa  105  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  32.02 
 
 
242 aa  105  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  32.39 
 
 
227 aa  105  7e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  35.64 
 
 
264 aa  104  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  32.89 
 
 
279 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  30.7 
 
 
238 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  35.79 
 
 
242 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  36.65 
 
 
238 aa  100  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4701  peptidase C26  34.47 
 
 
272 aa  99  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  37.91 
 
 
250 aa  98.6  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  41.21 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2077  peptidase C26  39.02 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  33.17 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  33.61 
 
 
313 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  35.2 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  35.71 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  30.29 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0813  peptidase C26  34.93 
 
 
264 aa  96.7  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  36.11 
 
 
252 aa  97.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  30 
 
 
231 aa  96.7  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  29.96 
 
 
273 aa  95.9  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  34.69 
 
 
278 aa  95.1  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  34.69 
 
 
278 aa  95.1  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  37.37 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  29.96 
 
 
312 aa  94.7  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5208  peptidase C26  34.19 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  32.27 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5760  peptidase C26  38.05 
 
 
267 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  43.05 
 
 
254 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0917  peptidase C26  34.17 
 
 
293 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0108  peptidase C26  35.5 
 
 
258 aa  92.8  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  38.95 
 
 
237 aa  92.8  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  34.65 
 
 
229 aa  92.4  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  35.81 
 
 
233 aa  92.4  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4921  peptidase C26  33.16 
 
 
299 aa  92  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  37.44 
 
 
275 aa  92  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  37.35 
 
 
251 aa  91.7  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  30.99 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  35.68 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  35.92 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1297  peptidase C26  32.16 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  35.05 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  35.05 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08940  predicted glutamine amidotransferase  34.14 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0342497  normal  0.666279 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  35.05 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  37.35 
 
 
493 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2584  peptidase C26  38.11 
 
 
237 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0482191  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  36.97 
 
 
235 aa  89.7  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  37.7 
 
 
243 aa  90.1  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0971  peptidase C26  34.78 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.174488  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  41.23 
 
 
259 aa  89.4  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  36.19 
 
 
272 aa  89  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  33.33 
 
 
264 aa  89  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  35.68 
 
 
262 aa  89  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  35.29 
 
 
255 aa  89  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4137  peptidase C26  37.65 
 
 
251 aa  88.6  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  31.53 
 
 
269 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0983  peptidase C26  37.65 
 
 
396 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290196  normal  0.093467 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  33.04 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  33.96 
 
 
249 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0545  peptidase C26  37.65 
 
 
396 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1798  peptidase C26  35.16 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.720671 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  36.36 
 
 
238 aa  87.8  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1024  peptidase C26  37.65 
 
 
396 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5346  peptidase C26  35.18 
 
 
255 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.176756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>