More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0204 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  100 
 
 
147 aa  300  4e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.01 
 
 
138 aa  169  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  56.16 
 
 
147 aa  166  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  9.95076e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 
144 aa  162  2e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.93441e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 
144 aa  162  2e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 
146 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 
146 aa  161  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 
146 aa  161  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 
146 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 
146 aa  161  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 
146 aa  161  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 
146 aa  161  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 
146 aa  161  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 
145 aa  160  4e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.9 
 
 
137 aa  160  4e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.2 
 
 
184 aa  159  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 
146 aa  159  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1544  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 
166 aa  159  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  53.79 
 
 
148 aa  159  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 
146 aa  158  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 
146 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1731  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 
141 aa  158  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  56.16 
 
 
156 aa  157  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  46.75 
 
 
159 aa  157  4e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  51.35 
 
 
151 aa  157  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 
151 aa  156  8e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 
154 aa  156  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  52.41 
 
 
153 aa  156  9e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 
151 aa  156  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  53.74 
 
 
157 aa  156  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.19 
 
 
145 aa  156  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.86 
 
 
152 aa  155  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 
149 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.54633e-05 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 
148 aa  155  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  55.41 
 
 
193 aa  154  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  54.36 
 
 
147 aa  154  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 
149 aa  154  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.03 
 
 
150 aa  154  5e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  51.03 
 
 
144 aa  154  5e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.27848e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  55.03 
 
 
150 aa  154  5e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.61 
 
 
142 aa  154  5e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 
153 aa  153  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  51.35 
 
 
153 aa  153  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 
146 aa  153  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  51.35 
 
 
153 aa  153  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 
151 aa  153  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 
146 aa  153  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
149 aa  153  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  55.88 
 
 
142 aa  153  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.96 
 
 
142 aa  153  9e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 
149 aa  152  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 
207 aa  152  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4088  3-dehydroquinate dehydratase  53.79 
 
 
151 aa  152  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  57.25 
 
 
193 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 
151 aa  152  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  53.02 
 
 
151 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  57.25 
 
 
193 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  57.25 
 
 
193 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 
149 aa  151  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 
150 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  4.60325e-05 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  57.25 
 
 
151 aa  151  3e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  57.25 
 
 
151 aa  151  3e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.71 
 
 
145 aa  151  3e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 
150 aa  151  3e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 
153 aa  151  3e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 
148 aa  151  3e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 
158 aa  151  3e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2435  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.47 
 
 
142 aa  151  3e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.476649 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2973  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 
144 aa  151  3e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 
150 aa  151  3e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 
150 aa  151  3e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 
150 aa  151  3e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 
150 aa  151  3e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  57.25 
 
 
151 aa  151  3e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 
207 aa  151  3e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  57.25 
 
 
151 aa  151  3e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 
156 aa  151  3e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 
152 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 
150 aa  150  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  55.88 
 
 
160 aa  150  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 
207 aa  150  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 
150 aa  150  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 
142 aa  150  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 
150 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 
150 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  52.7 
 
 
151 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 
150 aa  150  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  52.7 
 
 
151 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2337  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.61 
 
 
148 aa  150  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 
150 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 
161 aa  150  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 
150 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 
150 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 
151 aa  150  6e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  55.1 
 
 
147 aa  150  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  55.1 
 
 
147 aa  150  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 
156 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 
151 aa  149  9e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 
145 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.03 
 
 
149 aa  149  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>