More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3929 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 113 aa  228  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  92.92 
 
 		 113 aa  213  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  51.4 
 
 		 116 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  43.93 
 
 		 111 aa  96.7  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4967  transcriptional regulator, ArsR family  51.06 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1527  regulatory protein ArsR  53.19 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  48.89 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4378  ArsR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 125 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0649635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4262  ArsR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 125 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  51.72 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4102  transcriptional regulator ArsR family  51.19 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00250446  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  41.96 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3220  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  41.9 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  42.06 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  47.87 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 104 aa  83.6  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  41.51 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  48.89 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  39.64 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  39.45 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  43.43 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  44.19 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  40.22 
 
 		 115 aa  76.6  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  45.35 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  47.19 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  40.86 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  41.38 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  42.86 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2290  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 83 aa  73.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.05 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  41.05 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2699  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  37.86 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2787  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  38.83 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3214  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  39.08 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  38.38 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  42.17 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  40.4 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2896  regulatory protein ArsR  46.43 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  37.76 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>