More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0063 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  100 
 
 
258 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  98.84 
 
 
258 aa  515  1e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  88.57 
 
 
268 aa  444  1e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  88.57 
 
 
270 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  76.56 
 
 
261 aa  401  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  74.42 
 
 
279 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  78.19 
 
 
277 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  77.78 
 
 
254 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  69.08 
 
 
333 aa  359  3e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  71.55 
 
 
332 aa  355  5e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  71.01 
 
 
264 aa  354  9e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  70.29 
 
 
317 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 
336 aa  350  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  68.85 
 
 
317 aa  349  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  69.72 
 
 
321 aa  349  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  70.46 
 
 
316 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  72.15 
 
 
310 aa  347  8e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  66.03 
 
 
289 aa  346  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  69.29 
 
 
314 aa  346  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  66.79 
 
 
289 aa  342  5e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  70.29 
 
 
290 aa  340  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  65.38 
 
 
282 aa  339  3e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  69.92 
 
 
311 aa  338  4e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  70.29 
 
 
283 aa  338  5e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  65.62 
 
 
282 aa  327  1e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  61.79 
 
 
256 aa  322  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  68.97 
 
 
267 aa  319  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  67.09 
 
 
263 aa  317  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  64.14 
 
 
264 aa  312  3e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  64.49 
 
 
258 aa  311  8e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  60.08 
 
 
254 aa  310  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  65.4 
 
 
288 aa  308  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  61.67 
 
 
241 aa  307  8e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  61.67 
 
 
241 aa  306  2e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  62.18 
 
 
241 aa  306  2e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  64.22 
 
 
271 aa  303  1e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  62.07 
 
 
252 aa  301  5e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  62.96 
 
 
263 aa  300  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  62.34 
 
 
241 aa  298  6e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0106  ABC transporter related  58.1 
 
 
253 aa  298  8e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.995719 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 
246 aa  297  9e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  62.39 
 
 
240 aa  297  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  61.8 
 
 
253 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  60.49 
 
 
244 aa  296  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  61.8 
 
 
253 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  61.37 
 
 
253 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  61.38 
 
 
256 aa  296  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  60.67 
 
 
247 aa  296  3e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  59.66 
 
 
241 aa  295  5e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  61.48 
 
 
268 aa  295  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  61.51 
 
 
241 aa  295  6e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  61.28 
 
 
268 aa  294  9e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  58.37 
 
 
265 aa  293  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  58.3 
 
 
266 aa  293  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  58.94 
 
 
260 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  60 
 
 
241 aa  293  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  61.22 
 
 
262 aa  292  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  57.84 
 
 
268 aa  292  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  57.63 
 
 
264 aa  292  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.66 
 
 
241 aa  292  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  60.83 
 
 
267 aa  292  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  58.75 
 
 
244 aa  291  5e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  57.81 
 
 
240 aa  290  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  62.87 
 
 
244 aa  290  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  56.82 
 
 
258 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  59.32 
 
 
241 aa  290  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  59.32 
 
 
241 aa  290  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  58.13 
 
 
261 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  56.44 
 
 
258 aa  289  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  55.68 
 
 
258 aa  288  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0336  ABC transporter related  63.87 
 
 
250 aa  288  5e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.18468  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  60 
 
 
241 aa  288  5e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  58.13 
 
 
261 aa  288  5e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  59.91 
 
 
249 aa  288  5e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  56.44 
 
 
258 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  59.67 
 
 
255 aa  288  7e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0347  ABC transporter related  63.87 
 
 
255 aa  288  7e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  57.56 
 
 
244 aa  288  8e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  59.58 
 
 
241 aa  287  9e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.17 
 
 
241 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.17 
 
 
241 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  59.48 
 
 
243 aa  287  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  9.37515e-06 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  60.08 
 
 
255 aa  287  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.17 
 
 
241 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.17 
 
 
241 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.17 
 
 
241 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  55.3 
 
 
258 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  55.3 
 
 
258 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  61.73 
 
 
251 aa  286  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  57.54 
 
 
264 aa  287  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  55.3 
 
 
258 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  55.3 
 
 
258 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  55.3 
 
 
258 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  55.3 
 
 
258 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  57.81 
 
 
263 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  57.2 
 
 
262 aa  286  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  55.3 
 
 
258 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  61.76 
 
 
239 aa  286  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  55.68 
 
 
258 aa  285  3e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  60.34 
 
 
249 aa  286  3e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>