More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2619 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2619  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  501  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2362  ABC transporter related  75.2 
 
 		 255 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2780  ABC transporter related  77.17 
 
 		 263 aa  378  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.949494  normal  0.138295 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1017  ABC transporter related  66.93 
 
 		 260 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1101  ABC transporter related  66.93 
 
 		 260 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2552  ABC transporter related  69.29 
 
 		 260 aa  331  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2794  ABC transporter related  66.8 
 
 		 267 aa  315  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1542  ABC transporter-related protein  60.24 
 
 		 266 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264868  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2662  ABC transporter-related protein  50.77 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2305  ferric-citrate ABC transporter ATPase  49.02 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.891449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  43.75 
 
 		 264 aa  185  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 294 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  42.54 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0514  iron ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275192  normal  0.0986315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  42.32 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  43.16 
 
 		 266 aa  171  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  37.98 
 
 		 490 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  45.18 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  32.91 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 536 aa  165  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  40.42 
 
 		 268 aa  165  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  33.33 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  41.49 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.33 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1102  ABC transporter related  39.42 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  40.5 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  41 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  42.31 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  43.44 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  42.13 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.26 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  40.83 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0371  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATPase component  36.89 
 
 		 242 aa  159  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.140536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  37.45 
 
 		 265 aa  158  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  37.45 
 
 		 265 aa  158  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40 
 
 		 255 aa  158  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  36.9 
 
 		 414 aa  158  9e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1934  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 		 296 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0195526  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  43.69 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2080  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 296 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0934583  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  42.86 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1920  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components  41.63 
 
 		 296 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1188  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0867  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00729105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1631  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0942936  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0294  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.228173  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  43.95 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  39.13 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  39.36 
 
 		 270 aa  155  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  41.99 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  38.49 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.04 
 
 		 259 aa  155  8e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4499  ABC transporter related  40.57 
 
 		 271 aa  155  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  41.7 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4079  ABC transporter related  41.46 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  44.17 
 
 		 625 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4781  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  42.41 
 
 		 282 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  0.330442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  44.2 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  42.86 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  42.86 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1610  ABC transporter related  42.86 
 
 		 282 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  39.76 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  39.83 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  39.83 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  41.03 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  39.83 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.83 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  34.25 
 
 		 409 aa  152  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2524  ABC transporter related protein  42.22 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  43.75 
 
 		 282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.83 
 
 		 255 aa  151  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1001  ABC transporter related  44.21 
 
 		 260 aa  151  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  36.78 
 
 		 273 aa  151  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.85 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  37.24 
 
 		 419 aa  150  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  39.83 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  43.56 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  44.2 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37300  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  36.64 
 
 		 424 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 		 273 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 		 273 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 		 273 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  41.2 
 
 		 271 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.78 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.78 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  43.17 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  37.7 
 
 		 269 aa  149  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  39.41 
 
 		 286 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  38.91 
 
 		 283 aa  148  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  43.41 
 
 		 280 aa  148  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  44.5 
 
 		 262 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4372  ABC transporter related  36.07 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 		 273 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  40.96 
 
 		 255 aa  148  9e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>