More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2332 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  100 
 
 		 538 aa  1101    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.1 
 
 		 531 aa  597  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  54.89 
 
 		 531 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.77 
 
 		 534 aa  596  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  53.76 
 
 		 531 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.84 
 
 		 533 aa  554  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.16 
 
 		 565 aa  533  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  48.42 
 
 		 559 aa  521  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  45.05 
 
 		 583 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  40.47 
 
 		 550 aa  324  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  38.02 
 
 		 552 aa  323  6e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  34.95 
 
 		 556 aa  312  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  36.07 
 
 		 527 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  37.02 
 
 		 525 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  37.02 
 
 		 525 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  37.02 
 
 		 525 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.35 
 
 		 528 aa  302  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  35.95 
 
 		 529 aa  300  4e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  34.23 
 
 		 584 aa  296  6e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.88 
 
 		 572 aa  289  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.33 
 
 		 534 aa  287  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.4 
 
 		 531 aa  287  4e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  35.41 
 
 		 532 aa  286  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  35.64 
 
 		 527 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  33.53 
 
 		 554 aa  281  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  32.63 
 
 		 563 aa  281  3e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  37.06 
 
 		 545 aa  278  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.38 
 
 		 557 aa  276  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.13 
 
 		 521 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  36 
 
 		 521 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  35.41 
 
 		 524 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.55 
 
 		 540 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.52 
 
 		 518 aa  257  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.32 
 
 		 568 aa  256  6e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.78 
 
 		 579 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  31.03 
 
 		 586 aa  251  3e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  34.45 
 
 		 520 aa  250  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.61 
 
 		 564 aa  246  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  31.57 
 
 		 527 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.52 
 
 		 536 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  32.74 
 
 		 467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  28.47 
 
 		 532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.45 
 
 		 535 aa  197  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  30.15 
 
 		 546 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  28.83 
 
 		 531 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  27.39 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  28.69 
 
 		 532 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  28.6 
 
 		 534 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  29.56 
 
 		 502 aa  177  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.87 
 
 		 510 aa  175  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  28.11 
 
 		 534 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  28.73 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 		 470 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.63 
 
 		 516 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  30.67 
 
 		 520 aa  156  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.41 
 
 		 520 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  28.51 
 
 		 517 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  26.87 
 
 		 484 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.26 
 
 		 523 aa  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.05 
 
 		 484 aa  147  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  26.05 
 
 		 484 aa  147  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  26.05 
 
 		 484 aa  147  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  26.05 
 
 		 484 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  26.05 
 
 		 484 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  26.05 
 
 		 484 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  26.05 
 
 		 484 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  26.27 
 
 		 484 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  27.37 
 
 		 513 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.21 
 
 		 516 aa  144  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.23 
 
 		 457 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.23 
 
 		 474 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  34.98 
 
 		 572 aa  124  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.83 
 
 		 488 aa  123  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  25.85 
 
 		 471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  26.57 
 
 		 473 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.1 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  25.84 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.78 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.78 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.21 
 
 		 469 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  26.03 
 
 		 474 aa  118  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  25.15 
 
 		 495 aa  118  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0518  FAD linked oxidase domain protein  26.54 
 
 		 472 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  24.57 
 
 		 452 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.25 
 
 		 485 aa  117  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.79 
 
 		 469 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.79 
 
 		 469 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  24.79 
 
 		 469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.57 
 
 		 469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  26.07 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.33 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101334  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  25.33 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.07 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  26.07 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  26.07 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  26.07 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  25.21 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2031  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.6 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.27 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.07 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>