More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5758 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5758  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  100 
 
 		 318 aa  629  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1986  cobalamin synthesis protein P47K  59.33 
 
 		 336 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4358  cobalamin synthesis protein P47K  48.56 
 
 		 310 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7626  cobalamin synthesis protein/P47K  43.96 
 
 		 345 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6051  cobalamin synthesis protein P47K  45.85 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5665  cobalamin synthesis protein P47K  38.97 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326957 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  35.17 
 
 		 364 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  38.66 
 
 		 336 aa  168  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  39.78 
 
 		 349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0133  cobalamin synthesis protein, P47K  39.71 
 
 		 318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0107  cobalamin synthesis protein P47K  37.88 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0640379  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4765  cobalamin synthesis protein P47K  41.94 
 
 		 330 aa  159  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3251  cobalamin synthesis protein, P47K  36.49 
 
 		 290 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.784399  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4288  cobalamin synthesis protein, P47K  38.73 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  34.09 
 
 		 394 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  34.32 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  35.46 
 
 		 362 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4296  cobalamin synthesis protein, P47K  44.55 
 
 		 366 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0123  cobalamin synthesis protein, P47K  32.96 
 
 		 287 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6702  putative cobalamin synthesis protein cobW  35.11 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203286  normal  0.120205 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  30.94 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  28.81 
 
 		 327 aa  143  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  34.46 
 
 		 423 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  29.25 
 
 		 356 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  27.65 
 
 		 344 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  34.72 
 
 		 377 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  34.14 
 
 		 341 aa  136  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  33.9 
 
 		 402 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  27.81 
 
 		 342 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0294  cobalamin synthesis protein P47K  30.92 
 
 		 381 aa  136  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.226941 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  33.9 
 
 		 423 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  33.9 
 
 		 423 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  28.89 
 
 		 353 aa  136  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  30 
 
 		 349 aa  136  5e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  30.17 
 
 		 380 aa  136  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  30.53 
 
 		 335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  31.35 
 
 		 366 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  30.06 
 
 		 343 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  33.55 
 
 		 408 aa  135  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  28.01 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  28.75 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  29.85 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  33.84 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  33.89 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  29.09 
 
 		 350 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  28.99 
 
 		 349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  28.92 
 
 		 347 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  30.59 
 
 		 410 aa  132  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  28.61 
 
 		 350 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  31.83 
 
 		 320 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3924  cobalamin synthesis protein P47K  34.24 
 
 		 344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  31.63 
 
 		 388 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  36.13 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  29.81 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  32.78 
 
 		 410 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  31.02 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  34.01 
 
 		 406 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  27.45 
 
 		 353 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  28.08 
 
 		 364 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.61 
 
 		 345 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  30.07 
 
 		 395 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  28.16 
 
 		 338 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  36.32 
 
 		 379 aa  129  9.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  28.9 
 
 		 527 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  29.39 
 
 		 395 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  29.39 
 
 		 395 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  37.95 
 
 		 320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  36.67 
 
 		 353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  27.55 
 
 		 384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  36.32 
 
 		 372 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  30.07 
 
 		 410 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  31.76 
 
 		 402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  32.15 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  30.07 
 
 		 395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  31.72 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  28.01 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  29.52 
 
 		 396 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  31.72 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  36.96 
 
 		 354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  29.02 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  29.05 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1101  cobalamin synthesis protein P47K  32.2 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  33.45 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1193  hypothetical protein  31.86 
 
 		 442 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.619068  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  33.33 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  29.39 
 
 		 395 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1955  cobalamin synthesis protein P47K  30.52 
 
 		 392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  33.9 
 
 		 405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  37.78 
 
 		 329 aa  126  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  29.82 
 
 		 328 aa  126  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  29.82 
 
 		 328 aa  126  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  29.73 
 
 		 395 aa  126  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  31.31 
 
 		 407 aa  125  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  31.33 
 
 		 400 aa  125  8.000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  34.39 
 
 		 355 aa  125  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  36.41 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  31.42 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  35.29 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  30.55 
 
 		 437 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  27.94 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>