267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0914 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  100 
 
 
166 aa  342  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  84.94 
 
 
166 aa  304  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  80.84 
 
 
167 aa  283  7e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  80.84 
 
 
167 aa  281  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  80.24 
 
 
167 aa  280  7.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  66.87 
 
 
166 aa  221  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  64.42 
 
 
166 aa  214  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  64.07 
 
 
167 aa  209  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  65.03 
 
 
166 aa  209  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  63.47 
 
 
167 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  63.47 
 
 
167 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  65.64 
 
 
219 aa  207  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  63.47 
 
 
167 aa  207  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  63.47 
 
 
167 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  63.47 
 
 
167 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  66.87 
 
 
166 aa  207  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  62.87 
 
 
167 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  66.26 
 
 
209 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  66.87 
 
 
166 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  67.48 
 
 
166 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  66.87 
 
 
195 aa  204  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  66.87 
 
 
166 aa  203  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  66.26 
 
 
186 aa  203  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  58.23 
 
 
164 aa  190  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  56.88 
 
 
164 aa  184  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  54.32 
 
 
177 aa  176  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  55 
 
 
166 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  54.43 
 
 
162 aa  174  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  52.1 
 
 
171 aa  174  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  51.95 
 
 
160 aa  174  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  51.52 
 
 
169 aa  173  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  51.9 
 
 
167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  50.32 
 
 
160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  55.56 
 
 
164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  50.65 
 
 
160 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  53.8 
 
 
162 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  55.9 
 
 
164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  50 
 
 
160 aa  171  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  54.04 
 
 
165 aa  171  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  53.37 
 
 
171 aa  170  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  53.99 
 
 
176 aa  169  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  50.32 
 
 
160 aa  169  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  50 
 
 
160 aa  169  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  55 
 
 
164 aa  167  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  53.7 
 
 
259 aa  167  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 
169 aa  166  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  48.73 
 
 
161 aa  166  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 
162 aa  166  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 
162 aa  164  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 
162 aa  164  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 
162 aa  164  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 
162 aa  164  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 
162 aa  164  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 
162 aa  164  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 
162 aa  164  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 
162 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 
163 aa  163  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  46.54 
 
 
161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 
162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  47.06 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  45.98 
 
 
183 aa  162  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  49.02 
 
 
160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  50 
 
 
171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  48.05 
 
 
160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 
162 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  49.02 
 
 
160 aa  160  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  47.13 
 
 
160 aa  160  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  48.37 
 
 
160 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  48.37 
 
 
160 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 
170 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  50.32 
 
 
162 aa  159  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
177 aa  159  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  47.17 
 
 
163 aa  159  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 
170 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  50.91 
 
 
171 aa  158  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  50.62 
 
 
162 aa  157  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 
161 aa  157  5e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  52.15 
 
 
168 aa  157  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 
161 aa  157  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  45 
 
 
162 aa  157  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  50 
 
 
178 aa  157  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  44.16 
 
 
160 aa  157  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  50.63 
 
 
166 aa  157  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  50.63 
 
 
166 aa  156  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 
170 aa  156  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 
171 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  51.55 
 
 
167 aa  156  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  52.76 
 
 
168 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  52.12 
 
 
166 aa  155  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  46.75 
 
 
160 aa  155  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  46.54 
 
 
165 aa  154  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 
160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  45.62 
 
 
163 aa  154  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
171 aa  154  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  44.24 
 
 
172 aa  153  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  43.6 
 
 
173 aa  153  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  45.28 
 
 
159 aa  153  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
171 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  49.09 
 
 
195 aa  153  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>