More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4179 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4179  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
351 aa  686    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0370615  unclonable  0.000000000255221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4315  oxidoreductase, molybdopterin binding  81.32 
 
 
350 aa  523  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2545  oxidoreductase molybdopterin binding  44.6 
 
 
373 aa  247  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1262  oxidoreductase molybdopterin binding  45.04 
 
 
367 aa  224  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3236  oxidoreductase molybdopterin binding protein  40.77 
 
 
351 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143797  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.48 
 
 
501 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.73 
 
 
465 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  41.73 
 
 
524 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  36.76 
 
 
505 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2529  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.36 
 
 
181 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  38.35 
 
 
242 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.33 
 
 
230 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  41.73 
 
 
532 aa  73.9  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  37.96 
 
 
545 aa  73.2  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.58 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.7 
 
 
412 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.84 
 
 
505 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  37.4 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  37.88 
 
 
220 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.3 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.41 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.51 
 
 
505 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  31.87 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  37.31 
 
 
523 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.37 
 
 
229 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  31.33 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  35.82 
 
 
570 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2986  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.36 
 
 
395 aa  67  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0217905 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  32.37 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  35.82 
 
 
512 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.82 
 
 
512 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.82 
 
 
512 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.82 
 
 
511 aa  66.6  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  29.86 
 
 
406 aa  66.6  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.06 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1263  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.16 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.75 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  33.58 
 
 
256 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  28.57 
 
 
263 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  32.04 
 
 
407 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  32.9 
 
 
228 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4330  oxidoreductase molybdopterin binding  27.37 
 
 
396 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591499  normal  0.212281 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  32.22 
 
 
426 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
270 aa  65.1  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  36.15 
 
 
608 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  30.81 
 
 
258 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  32.1 
 
 
372 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  39.29 
 
 
515 aa  64.3  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  33.83 
 
 
233 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  40.2 
 
 
437 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  31.55 
 
 
258 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  30.43 
 
 
234 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.43 
 
 
416 aa  63.5  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  31.32 
 
 
446 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  33.09 
 
 
528 aa  63.2  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  33.09 
 
 
531 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  33.11 
 
 
428 aa  62.8  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  33.11 
 
 
428 aa  62.8  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0833  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.59 
 
 
204 aa  62.8  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1719  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.71 
 
 
198 aa  62.8  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135393  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  29.94 
 
 
405 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.81 
 
 
253 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  31.21 
 
 
199 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
259 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  31.21 
 
 
369 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  29.94 
 
 
405 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.82 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.06 
 
 
512 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.83 
 
 
240 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  31.03 
 
 
220 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  27.14 
 
 
495 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.76 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  26.61 
 
 
414 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.94 
 
 
400 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  35.88 
 
 
202 aa  61.2  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.74907  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  30.83 
 
 
489 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.51 
 
 
430 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.3 
 
 
508 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  31.85 
 
 
427 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  30.51 
 
 
403 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2579  oxidoreductase molybdopterin binding  28.05 
 
 
224 aa  60.1  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.26 
 
 
313 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  31.76 
 
 
241 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0889  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.82 
 
 
367 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204318  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.89 
 
 
233 aa  60.1  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  29.94 
 
 
425 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  30.68 
 
 
407 aa  59.7  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  28.12 
 
 
440 aa  59.7  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  30.57 
 
 
431 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  29.48 
 
 
220 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  31.85 
 
 
263 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32 
 
 
232 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.81 
 
 
525 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.72 
 
 
531 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.23 
 
 
209 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  31.07 
 
 
403 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  32.84 
 
 
554 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  30.51 
 
 
256 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  31.64 
 
 
361 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  30.82 
 
 
258 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>