More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1586 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1586  chemotaxis protein, CheW3  100 
 
 
178 aa  356  8e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0238  putative CheW protein  99.44 
 
 
178 aa  355  3e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0266  putative CheW protein  81.14 
 
 
177 aa  284  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.452082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  43.17 
 
 
158 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  40.14 
 
 
179 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  42.45 
 
 
160 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  43.48 
 
 
162 aa  101  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  43.48 
 
 
157 aa  100  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  38.36 
 
 
164 aa  96.3  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  38.06 
 
 
162 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  37.06 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  40.74 
 
 
162 aa  91.7  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  36.72 
 
 
159 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0616  CheW protein  38.46 
 
 
163 aa  89  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662625  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  34.51 
 
 
171 aa  88.2  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  37.96 
 
 
170 aa  87.4  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  33.81 
 
 
163 aa  84.7  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  32.47 
 
 
169 aa  83.6  1e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  31.82 
 
 
164 aa  82.8  2e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  32.86 
 
 
178 aa  83.2  2e-15  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  38.41 
 
 
181 aa  82  4e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  33.09 
 
 
159 aa  81.6  6e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.09 
 
 
159 aa  81.6  6e-15  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  33.09 
 
 
159 aa  81.6  6e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  33.09 
 
 
159 aa  81.6  6e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  32.24 
 
 
154 aa  81.3  7e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  33.81 
 
 
164 aa  80.9  8e-15  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  35.85 
 
 
185 aa  80.5  1e-14  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  29.58 
 
 
165 aa  80.9  1e-14  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  31.72 
 
 
161 aa  80.1  1e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  31.37 
 
 
164 aa  79.7  2e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  37.68 
 
 
185 aa  79.7  2e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  31.25 
 
 
163 aa  79.7  2e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  29.87 
 
 
167 aa  79  3e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  30.49 
 
 
159 aa  79  4e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.43 
 
 
164 aa  79  4e-14  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  31.65 
 
 
159 aa  78.6  4e-14  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  31.08 
 
 
157 aa  78.6  5e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  31.65 
 
 
159 aa  78.2  5e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  27.44 
 
 
187 aa  78.2  6e-14  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.47 
 
 
164 aa  77.8  7e-14  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  31.65 
 
 
164 aa  77.8  8e-14  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  30.94 
 
 
171 aa  76.3  2e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  30.41 
 
 
162 aa  76.6  2e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.65 
 
 
164 aa  76.3  2e-13  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  30.5 
 
 
169 aa  76.3  2e-13  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  31.65 
 
 
164 aa  75.5  3e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  32.37 
 
 
164 aa  75.9  3e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  32.37 
 
 
164 aa  75.9  3e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0150  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.03 
 
 
153 aa  75.9  3e-13  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  30 
 
 
179 aa  75.9  3e-13  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.39 
 
 
174 aa  75.9  3e-13  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  32.86 
 
 
161 aa  75.1  4e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  30.94 
 
 
161 aa  75.5  4e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  30.2 
 
 
331 aa  75.1  5e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  29.14 
 
 
163 aa  75.1  5e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  29.93 
 
 
161 aa  75.1  5e-13  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6736  CheW protein  33.76 
 
 
156 aa  75.1  5e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17041  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  30.94 
 
 
164 aa  75.1  5e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  30.22 
 
 
159 aa  74.3  7e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  31.06 
 
 
163 aa  74.3  8e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  30.94 
 
 
164 aa  74.3  9e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  30.22 
 
 
159 aa  74.3  9e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  30.94 
 
 
164 aa  73.6  1e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  30.94 
 
 
164 aa  73.9  1e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  30.94 
 
 
164 aa  73.6  1e-12  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  30.32 
 
 
159 aa  73.6  1e-12  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  30.94 
 
 
164 aa  73.6  1e-12  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.77 
 
 
164 aa  73.9  1e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.94 
 
 
164 aa  73.6  1e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  30.94 
 
 
164 aa  73.9  1e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  30.94 
 
 
164 aa  73.9  1e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.77 
 
 
164 aa  73.9  1e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  30.94 
 
 
164 aa  73.9  1e-12  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  30.94 
 
 
164 aa  73.9  1e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  30.94 
 
 
161 aa  73.2  2e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  28.77 
 
 
164 aa  72.4  3e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  33.09 
 
 
162 aa  72  4e-12  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  33.09 
 
 
165 aa  71.6  5e-12  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  30.94 
 
 
164 aa  71.6  5e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  30.22 
 
 
163 aa  71.2  6e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  30.22 
 
 
162 aa  71.6  6e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  27.34 
 
 
141 aa  71.2  7e-12  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  32.89 
 
 
167 aa  71.2  7e-12  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0144  CheW protein  31.41 
 
 
156 aa  71.2  8e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.675367  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.06 
 
 
165 aa  70.9  8e-12  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  29.93 
 
 
163 aa  70.9  9e-12  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  41.56 
 
 
159 aa  70.1  1e-11  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3263  CheW protein  32.68 
 
 
170 aa  70.5  1e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  29.17 
 
 
189 aa  70.5  1e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  31.69 
 
 
162 aa  70.1  2e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  30.2 
 
 
146 aa  69.7  2e-11  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  32.52 
 
 
194 aa  69.7  2e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  29.38 
 
 
187 aa  69.3  3e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  32.73 
 
 
167 aa  69.3  3e-11  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3562  CheW protein  33.82 
 
 
169 aa  68.9  3e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  29.93 
 
 
163 aa  68.9  4e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  30.73 
 
 
174 aa  68.6  4e-11  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  35.4 
 
 
161 aa  68.6  4e-11  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  28.57 
 
 
146 aa  68.9  4e-11  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>