More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0105 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2437  NADH dehydrogenase subunit G  41.47 
 
 		 908 aa  640    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02208  NADH dehydrogenase subunit G  41.47 
 
 		 910 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1374  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  41.36 
 
 		 908 aa  636    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00828707  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4738  NADH dehydrogenase subunit G  53.76 
 
 		 877 aa  809    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656278  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1741  NADH dehydrogenase subunit G  97.91 
 
 		 860 aa  1494    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.217192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2659  NADH dehydrogenase subunit G  41.36 
 
 		 908 aa  638    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322834  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3608  NADH dehydrogenase subunit G  42.26 
 
 		 904 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0967194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0105  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 860 aa  1678    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.831692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2576  NADH dehydrogenase subunit G  41.47 
 
 		 908 aa  639    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1352  NADH dehydrogenase subunit G  54.24 
 
 		 872 aa  778    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.236873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4066  NADH dehydrogenase subunit G  56.19 
 
 		 871 aa  831    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0945726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1331  NADH dehydrogenase subunit G  56.15 
 
 		 872 aa  849    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1694  NADH dehydrogenase subunit G  90.8 
 
 		 860 aa  1427    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0130655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1369  NADH dehydrogenase subunit G  41.36 
 
 		 908 aa  636    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852491  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02168  hypothetical protein  41.47 
 
 		 910 aa  640    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3422  NADH dehydrogenase subunit G  41.36 
 
 		 908 aa  635  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.722841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2432  NADH dehydrogenase subunit G  41.24 
 
 		 908 aa  634  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2417  NADH dehydrogenase subunit G  43.15 
 
 		 902 aa  633  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58498  normal  0.233551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2827  NADH dehydrogenase subunit G  41.45 
 
 		 910 aa  632  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0965571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3202  NADH dehydrogenase subunit G  41.98 
 
 		 905 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119939  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3370  NADH dehydrogenase I, G subunit  41.87 
 
 		 905 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1497  NADH dehydrogenase subunit G  40.83 
 
 		 908 aa  628  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.838261  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1122  NADH dehydrogenase subunit G  42.39 
 
 		 909 aa  623  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.741047  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1018  NADH dehydrogenase subunit G  42.32 
 
 		 942 aa  623  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181039  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2564  NADH dehydrogenase subunit G  42.22 
 
 		 905 aa  625  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2767  NADH dehydrogenase subunit G  40.94 
 
 		 908 aa  623  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124088  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1354  NADH dehydrogenase subunit G  44.22 
 
 		 929 aa  619  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1016  NADH dehydrogenase subunit G  42.47 
 
 		 909 aa  622  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3303  NADH dehydrogenase subunit G  40.65 
 
 		 915 aa  619  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113952  normal  0.988711 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1399  NADH dehydrogenase subunit G  41.96 
 
 		 908 aa  620  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28490  NADH dehydrogenase subunit G  42.92 
 
 		 903 aa  620  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45196  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1115  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  45.24 
 
 		 902 aa  617  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2562  NADH dehydrogenase subunit G  41.04 
 
 		 908 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2669  NADH dehydrogenase subunit G  41.04 
 
 		 908 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1565  NADH dehydrogenase subunit G  40.04 
 
 		 914 aa  612  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1741  NADH dehydrogenase subunit G  42.44 
 
 		 904 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0398307  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2462  NADH dehydrogenase subunit G  41.04 
 
 		 908 aa  615  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289624  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1459  NADH dehydrogenase subunit G  40.16 
 
 		 914 aa  614  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3696  NADH dehydrogenase subunit G  42.21 
 
 		 904 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2551  NADH dehydrogenase subunit G  41.04 
 
 		 908 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0113562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1868  NADH dehydrogenase subunit G  42.44 
 
 		 904 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.052963 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2507  NADH dehydrogenase subunit G  41.28 
 
 		 908 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29940  NADH dehydrogenase subunit G  41.87 
 
 		 905 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4124  NADH dehydrogenase subunit G  42.21 
 
 		 904 aa  612  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1811  NADH dehydrogenase subunit G  40.18 
 
 		 914 aa  611  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.821067 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2545  NADH dehydrogenase subunit G  41.24 
 
 		 908 aa  611  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0568157  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3820  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.91 
 
 		 899 aa  593  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0376  NADH dehydrogenase subunit G  39.07 
 
 		 909 aa  594  1e-168  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0886279  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0713  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  42.74 
 
 		 896 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3127  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  44.06 
 
 		 920 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1694  NADH dehydrogenase subunit G  34.82 
 
 		 1010 aa  531  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2865  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.07 
 
 		 947 aa  485  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119541  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0589  NADH dehydrogenase subunit G  43.74 
 
 		 1030 aa  451  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0578  NADH dehydrogenase subunit G  43.58 
 
 		 1039 aa  451  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0326  NADH dehydrogenase subunit G  37.06 
 
 		 631 aa  361  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0159  NADH dehydrogenase subunit G  37.66 
 
 		 642 aa  356  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3439  NADH dehydrogenase subunit G  37.36 
 
 		 677 aa  355  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0209  NADH dehydrogenase subunit G  37.82 
 
 		 798 aa  348  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0175  NADH dehydrogenase subunit G  36.16 
 
 		 648 aa  334  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0157  NADH dehydrogenase subunit G  35.96 
 
 		 648 aa  325  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.735826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1954  NADH dehydrogenase subunit G  34.1 
 
 		 818 aa  321  5e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.509944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.81 
 
 		 797 aa  244  6e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  29.94 
 
 		 797 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  27.64 
 
 		 771 aa  216  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  29.97 
 
 		 791 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  29.33 
 
 		 784 aa  212  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.11 
 
 		 798 aa  211  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  29.75 
 
 		 689 aa  211  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  30.09 
 
 		 783 aa  209  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  28.06 
 
 		 715 aa  209  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  27.2 
 
 		 771 aa  207  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  26.09 
 
 		 783 aa  207  7e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  27.62 
 
 		 710 aa  207  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  29.21 
 
 		 776 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  29.21 
 
 		 776 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  29.21 
 
 		 776 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  29.21 
 
 		 776 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0751  NADH dehydrogenase subunit G  26.6 
 
 		 660 aa  206  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0442747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  29.21 
 
 		 776 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  29.21 
 
 		 776 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.22 
 
 		 913 aa  205  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  29.06 
 
 		 776 aa  205  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01310  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  27.87 
 
 		 775 aa  204  5e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.754341  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  28.12 
 
 		 809 aa  204  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  27.98 
 
 		 721 aa  204  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  27.45 
 
 		 808 aa  204  7e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  28.9 
 
 		 777 aa  204  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  27.15 
 
 		 782 aa  203  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  27.15 
 
 		 782 aa  203  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  28.25 
 
 		 783 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4627  NADH dehydrogenase subunit G  30.19 
 
 		 692 aa  202  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  28.93 
 
 		 795 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  28.59 
 
 		 777 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  29 
 
 		 717 aa  201  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  29.02 
 
 		 797 aa  201  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  29.52 
 
 		 776 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  28.36 
 
 		 779 aa  201  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  25.9 
 
 		 783 aa  201  7e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  29.61 
 
 		 776 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  29.37 
 
 		 776 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>