More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1929 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  100 
 
 
425 aa  834    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  66.35 
 
 
421 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  68.47 
 
 
420 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  68.94 
 
 
421 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.66 
 
 
419 aa  153  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.55 
 
 
430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  32.69 
 
 
434 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  32.36 
 
 
434 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  23.82 
 
 
419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0690  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.41 
 
 
419 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.16906  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  31.33 
 
 
445 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  31.35 
 
 
446 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  29.27 
 
 
450 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  28.18 
 
 
424 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.47 
 
 
456 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  31.4 
 
 
445 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  27.44 
 
 
419 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  28 
 
 
438 aa  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  28 
 
 
438 aa  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  27.86 
 
 
442 aa  99.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.83 
 
 
453 aa  97.8  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  28.54 
 
 
445 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.63 
 
 
448 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.58 
 
 
444 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  29.02 
 
 
447 aa  93.2  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.84 
 
 
444 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.11 
 
 
443 aa  89.7  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  25.44 
 
 
441 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  28.24 
 
 
481 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  27.65 
 
 
443 aa  88.6  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  28.07 
 
 
464 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  29.01 
 
 
460 aa  89  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  27.29 
 
 
444 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  32.56 
 
 
444 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  26.63 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.67 
 
 
447 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  28.12 
 
 
440 aa  83.2  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  27.48 
 
 
443 aa  83.2  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  28.29 
 
 
447 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  27.45 
 
 
447 aa  80.1  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  29.18 
 
 
489 aa  80.1  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  28.19 
 
 
447 aa  79.7  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  27.25 
 
 
447 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  27.21 
 
 
438 aa  74.7  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  29.47 
 
 
446 aa  73.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.66 
 
 
494 aa  70.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0392  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.39 
 
 
469 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1200  methane monooxygenase, C subunit  29.25 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.06 
 
 
465 aa  67.4  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  27.34 
 
 
496 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.17 
 
 
752 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0492  ferric reductase  21.77 
 
 
435 aa  65.1  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.673317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  26.06 
 
 
481 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.77 
 
 
368 aa  64.3  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2489  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.07 
 
 
328 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1301  ferric reductase domain protein transmembrane component  25.19 
 
 
447 aa  63.9  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3089  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.49 
 
 
328 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6582  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.5 
 
 
341 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10458  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2361  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.36 
 
 
514 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000108659 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1304  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.27 
 
 
340 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6526  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.27 
 
 
340 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.57 
 
 
375 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  26.77 
 
 
395 aa  60.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1381  ferric reductase-like  27.09 
 
 
307 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000207165  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.96 
 
 
341 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170872 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0800  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.52 
 
 
328 aa  60.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0980  oxidoreductase FAD-binding region  26.92 
 
 
327 aa  60.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.85 
 
 
232 aa  60.5  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.61 
 
 
336 aa  60.5  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.11 
 
 
375 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6133  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.38 
 
 
340 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08610  Benzoate 1,2-Dioxygenase Reductase  31.39 
 
 
336 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06023  oxidoreductase, FAD-binding, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07600)  25.55 
 
 
640 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0324685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2780  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  31.72 
 
 
336 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963847  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3584  phthalate 4,5-dioxygenase  35.81 
 
 
318 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.57 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  28.21 
 
 
357 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3391  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.94 
 
 
242 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00300696  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  23.98 
 
 
465 aa  57.4  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7048  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  26.09 
 
 
340 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268276 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0816  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.04 
 
 
407 aa  57  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.709855  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  32.04 
 
 
782 aa  57  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0751  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  22.56 
 
 
407 aa  56.6  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.013276  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1001  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  27.85 
 
 
339 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2583  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  27.85 
 
 
339 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2519  oxidoreductase FAD-binding region  27.81 
 
 
350 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2110  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.39 
 
 
335 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0440223  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2380  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  23.9 
 
 
409 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.650264  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2876  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.95 
 
 
173 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  27.68 
 
 
382 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.68 
 
 
382 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00750  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  25.88 
 
 
410 aa  55.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1267  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.45 
 
 
350 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  28.48 
 
 
418 aa  55.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3238  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.39 
 
 
338 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.3 
 
 
414 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2133  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  23.9 
 
 
409 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0420648  normal  0.988223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.23 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0954  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  25.62 
 
 
408 aa  54.7  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.310824  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.7 
 
 
340 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324243  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>