More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0168 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 		 262 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  70.11 
 
 		 261 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  67.18 
 
 		 269 aa  348  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  72.59 
 
 		 268 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  58.02 
 
 		 269 aa  301  7.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  46.09 
 
 		 262 aa  210  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  41.92 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  43.02 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  42.04 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  42.25 
 
 		 272 aa  198  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  45.93 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  42.64 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  42.15 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  42.15 
 
 		 256 aa  191  9e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  44.79 
 
 		 267 aa  191  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  41.47 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  46.53 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  41.63 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  45.56 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  44 
 
 		 270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  39.85 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  45.85 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  39.67 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  39.67 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  39.67 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  45.31 
 
 		 264 aa  178  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  37.6 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  38.8 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  44.86 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  39.51 
 
 		 272 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4590  ABC transporter related  44.96 
 
 		 274 aa  175  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  41.57 
 
 		 260 aa  175  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  40.74 
 
 		 269 aa  175  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  41.22 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  43.13 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  41.96 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  38.76 
 
 		 288 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  38.76 
 
 		 288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  40.53 
 
 		 272 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  35.91 
 
 		 264 aa  171  9e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  43.02 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  37.98 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  40.41 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  37.98 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3877  ABC transporter related  45.8 
 
 		 266 aa  168  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  40.82 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  40.15 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  42.25 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  41.41 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 264 aa  166  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  39.29 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  39.92 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  40.56 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  39.52 
 
 		 259 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  44.31 
 
 		 293 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  42.39 
 
 		 253 aa  165  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  36.43 
 
 		 274 aa  165  9e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  41.46 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  39.25 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  37.71 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  41.46 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  38.59 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  36.93 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  41.96 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  40.47 
 
 		 266 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  36.55 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  39.59 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  37.8 
 
 		 293 aa  160  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  38.08 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  38.08 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  40.39 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  38.08 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.08 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  37.4 
 
 		 297 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.46 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  37.4 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  37.4 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  39.85 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  39.23 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  39.54 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  39.54 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  37.4 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  39.54 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  35.55 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  32.42 
 
 		 256 aa  158  7e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  42.92 
 
 		 277 aa  158  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  37.79 
 
 		 419 aa  158  8e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  41.15 
 
 		 254 aa  158  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.69 
 
 		 255 aa  158  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0077  ABC transporter related protein  42.75 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  34.36 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  37.74 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0556  ABC transporter related  37.07 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  38.82 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  34.09 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  39.46 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>