More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1899 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2104  major facilitator family transporter  97.44 
 
 
432 aa  813  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1899  major facilitator transporter  100 
 
 
430 aa  857  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00967745  normal  0.065462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6273  citrate transporter  82.75 
 
 
429 aa  687  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318839  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3864  general substrate transporter  85.95 
 
 
430 aa  758  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72280  citrate transporter  82.52 
 
 
429 aa  670  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3059  sugar transporter transmembrane protein  73.29 
 
 
431 aa  631  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.45158 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1366  major facilitator transporter  73.62 
 
 
435 aa  630  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1949  general substrate transporter  72.58 
 
 
429 aa  626  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2992  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  71.76 
 
 
433 aa  616  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3339  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  71.53 
 
 
437 aa  614  1e-174  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0721  general substrate transporter  70.29 
 
 
433 aa  609  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0155857  normal  0.463435 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2370  general substrate transporter  70.7 
 
 
477 aa  606  1e-172  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114747  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0958  major facilitator superfamily citrate/H(+) symporter  70.73 
 
 
433 aa  604  1e-172  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646724  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0903  general substrate transporter  71.46 
 
 
431 aa  602  1e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289816  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1618  citrate-proten symporter  71.05 
 
 
431 aa  603  1e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3060  transporter transmembrane protein  71.36 
 
 
433 aa  602  1e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4140  major facilitator transporter  70.98 
 
 
431 aa  602  1e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0891  general substrate transporter  71.46 
 
 
431 aa  602  1e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3029  General substrate transporter  69.73 
 
 
433 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.07969  normal  0.0112235 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3016  citrate-proton symporter  70.56 
 
 
446 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2600  citrate-proton symporter  70.56 
 
 
431 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0175  citrate-proton symporter  70.56 
 
 
431 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2968  citrate-proton symporter  70.56 
 
 
431 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2908  citrate-proton symporter  70.56 
 
 
431 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566614  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0454  citrate-proten symporter  70.56 
 
 
431 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0971  citrate-proton symporter  70.56 
 
 
431 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.710178  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1646  general substrate transporter  68.26 
 
 
439 aa  588  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0986  general substrate transporter  69.64 
 
 
431 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535486  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1027  general substrate transporter  69.64 
 
 
431 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0728  General substrate transporter  68.37 
 
 
454 aa  581  1e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0548  general substrate transporter  69.64 
 
 
488 aa  583  1e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6263  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  67.31 
 
 
431 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268636  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4980  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  67.79 
 
 
431 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0530  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  67.55 
 
 
431 aa  577  1e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6665  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  67.31 
 
 
431 aa  577  1e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6430  metabolite  67.31 
 
 
431 aa  577  1e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0543  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  66.83 
 
 
431 aa  573  1e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6015  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  67.15 
 
 
438 aa  572  1e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.898773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2667  general substrate transporter  66.99 
 
 
437 aa  568  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6371  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  68.13 
 
 
431 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86681 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5623  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  67.79 
 
 
431 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6136  general substrate transporter  66.59 
 
 
477 aa  562  1e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2761  General substrate transporter  66.18 
 
 
437 aa  559  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5520  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  65.38 
 
 
432 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.112643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3167  citrate-proton symport  65.7 
 
 
433 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.905782  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6132  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  64.95 
 
 
440 aa  555  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6303  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  66.43 
 
 
438 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3510  citrate-proton symport  65.4 
 
 
430 aa  557  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0855554  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6012  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  64.85 
 
 
432 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3336  citrate transporter  66.01 
 
 
433 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5624  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  66.5 
 
 
439 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.181082  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1663  general substrate transporter  62.56 
 
 
425 aa  550  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5880  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  65.7 
 
 
440 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.744654  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0845  citrate-proton symporter  62.41 
 
 
434 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0736  citrate-proton symporter  62.41 
 
 
434 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0748  citrate-proton symporter  62.41 
 
 
434 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.93839 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0809  citrate-proton symporter  62.41 
 
 
434 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.511471  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0796  citrate-proton symporter  62.41 
 
 
434 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3179  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  60.91 
 
 
431 aa  512  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02399  citrate carrier protein  60.29 
 
 
425 aa  501  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5091  general substrate transporter  61.59 
 
 
435 aa  492  1e-138  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6399  General substrate transporter  60.68 
 
 
431 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1915  major facilitator superfamily metabolite(citrate)/H(+) symporter  59.12 
 
 
440 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2273  general substrate transporter  58.6 
 
 
440 aa  478  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979998  normal  0.381458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2401  General substrate transporter  59.02 
 
 
430 aa  460  1e-128  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7138  citrate-proton symporter  55.97 
 
 
437 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.575895  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  41.22 
 
 
443 aa  332  9e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  43.56 
 
 
427 aa  331  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  45.02 
 
 
425 aa  328  9e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  42.86 
 
 
425 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  42.62 
 
 
425 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  42.86 
 
 
425 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  42.86 
 
 
425 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  42.86 
 
 
425 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.15 
 
 
425 aa  322  9e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 
425 aa  319  8e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  41.9 
 
 
425 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  40.43 
 
 
443 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 
438 aa  315  1e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  42.97 
 
 
499 aa  315  1e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  40.9 
 
 
438 aa  308  1e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.24 
 
 
430 aa  307  2e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  42.36 
 
 
425 aa  307  2e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  40.65 
 
 
461 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.66 
 
 
454 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  38.66 
 
 
457 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  39.61 
 
 
440 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  39.76 
 
 
430 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  40.96 
 
 
436 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  40.24 
 
 
436 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  39.62 
 
 
435 aa  292  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  39.29 
 
 
440 aa  292  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  39.86 
 
 
435 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  41.11 
 
 
430 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  39.86 
 
 
435 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  39.62 
 
 
435 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  39.86 
 
 
435 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  39.62 
 
 
435 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  40.87 
 
 
430 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  40.87 
 
 
430 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>