More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1669 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  88.09 
 
 		 403 aa  716    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  87.59 
 
 		 403 aa  716    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  87.1 
 
 		 403 aa  711    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  97.27 
 
 		 403 aa  785    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  100 
 
 		 403 aa  828    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  83.62 
 
 		 403 aa  703    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  94.04 
 
 		 403 aa  764    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  81.64 
 
 		 403 aa  668    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  87.34 
 
 		 403 aa  715    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  83.37 
 
 		 403 aa  667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  84.12 
 
 		 403 aa  689    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  69.41 
 
 		 393 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.8 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  64.81 
 
 		 392 aa  528  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  66.14 
 
 		 383 aa  521  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  64.56 
 
 		 396 aa  518  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.66 
 
 		 397 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1268  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  64.27 
 
 		 402 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.373712  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.2 
 
 		 397 aa  511  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.99 
 
 		 399 aa  508  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1551  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  63.87 
 
 		 407 aa  508  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.75247  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.52 
 
 		 404 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  63.19 
 
 		 389 aa  504  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.52 
 
 		 404 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  63.28 
 
 		 406 aa  504  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.42 
 
 		 393 aa  488  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.9 
 
 		 395 aa  490  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  62.99 
 
 		 396 aa  484  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.99 
 
 		 394 aa  475  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1730  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.5 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000563319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0792  cystathionine gamma-synthase  54.66 
 
 		 424 aa  455  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.145563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.61 
 
 		 402 aa  455  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.1 
 
 		 394 aa  458  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.89 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2117  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.38 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0798  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.17 
 
 		 422 aa  451  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.40297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.35 
 
 		 402 aa  450  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4401  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.89 
 
 		 396 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3966  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.89 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0704678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4614  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.38 
 
 		 396 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0761  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.74 
 
 		 405 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2437  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.74 
 
 		 423 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3861  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.42 
 
 		 410 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1608  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.75 
 
 		 411 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2299  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.74 
 
 		 423 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3758  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.2 
 
 		 406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2049  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.09 
 
 		 391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1713  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.49 
 
 		 396 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292156  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2298  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.69 
 
 		 401 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1657  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.49 
 
 		 396 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0687  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.23 
 
 		 405 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160219  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1866  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.49 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1093  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.24 
 
 		 404 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.560821 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6834  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.96 
 
 		 396 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3356  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.84 
 
 		 410 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0537  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.49 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2459  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.52 
 
 		 402 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00148709  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2735  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.3 
 
 		 404 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2873  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.71 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2225  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.56 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.833274  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1864  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.66 
 
 		 411 aa  429  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.76 
 
 		 396 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2682  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  53.71 
 
 		 407 aa  425  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1998  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.36 
 
 		 409 aa  423  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.469724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1689  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.58 
 
 		 413 aa  420  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.79324 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.8 
 
 		 452 aa  411  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0722667 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  50.52 
 
 		 396 aa  401  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  47.26 
 
 		 388 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2639  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  45.74 
 
 		 391 aa  386  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2947  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.29 
 
 		 419 aa  381  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.3 
 
 		 406 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2150  cystathionine gamma-synthase  55.08 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  52.99 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  44.59 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2410  trans-sulfuration enzyme family protein  49.61 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0305  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.47 
 
 		 398 aa  375  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226958  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0318  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.47 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1236  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.7 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.43898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0398  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.89 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1854  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.39 
 
 		 397 aa  371  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.58476  decreased coverage  0.00243487 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.91 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35030  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.06 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.02 
 
 		 408 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0513  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.33 
 
 		 410 aa  363  3e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.33 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2393  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.5 
 
 		 404 aa  361  1e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.168744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0516  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.8 
 
 		 412 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.17 
 
 		 408 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3645  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.61 
 
 		 402 aa  359  6e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0098  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.14 
 
 		 396 aa  358  7e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0538  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.55 
 
 		 412 aa  358  9e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0985823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0526  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.55 
 
 		 412 aa  358  9e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  44.07 
 
 		 397 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1699  Methionine gamma-lyase  45.08 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3103  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.24 
 
 		 394 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5251  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.05 
 
 		 403 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.903252  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0688  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.96 
 
 		 411 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175139 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3860  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.36 
 
 		 402 aa  355  8.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1851  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.63 
 
 		 404 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225194  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3732  Cystathionine gamma-lyase  46.46 
 
 		 393 aa  353  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.136347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>