150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0872 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  90.06 
 
 		 523 aa  964    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  100 
 
 		 523 aa  1080    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  61.27 
 
 		 558 aa  619  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  50 
 
 		 529 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  46.5 
 
 		 530 aa  430  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  46.76 
 
 		 522 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  44.42 
 
 		 555 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  42.64 
 
 		 530 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  44.33 
 
 		 563 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  43.91 
 
 		 513 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  42.29 
 
 		 511 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  43.05 
 
 		 534 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  42.48 
 
 		 534 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  44.47 
 
 		 549 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  42.45 
 
 		 538 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  41.47 
 
 		 528 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  40.89 
 
 		 530 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  43.52 
 
 		 523 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  40.23 
 
 		 528 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1411  alkaline phosphatase  45.89 
 
 		 529 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  42.18 
 
 		 552 aa  367  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  43.74 
 
 		 494 aa  365  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  40.45 
 
 		 534 aa  364  2e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  44.29 
 
 		 524 aa  362  8e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  40.23 
 
 		 529 aa  361  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  41.63 
 
 		 529 aa  358  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  42.57 
 
 		 516 aa  356  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  42.17 
 
 		 531 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  41.32 
 
 		 519 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  42.22 
 
 		 545 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  40.15 
 
 		 544 aa  347  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  40.48 
 
 		 535 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  39.77 
 
 		 529 aa  342  8e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  42.94 
 
 		 521 aa  342  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  39.85 
 
 		 531 aa  341  1e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  41.39 
 
 		 540 aa  341  2e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4801  alkaline phosphatase  41.33 
 
 		 502 aa  341  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  42.86 
 
 		 523 aa  339  7e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  42.65 
 
 		 524 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  41.2 
 
 		 538 aa  335  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  41.1 
 
 		 525 aa  332  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  42.06 
 
 		 554 aa  320  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0541  alkaline phosphatase  39.31 
 
 		 515 aa  319  9e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  41.97 
 
 		 618 aa  318  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  40.81 
 
 		 520 aa  317  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  39.24 
 
 		 538 aa  317  5e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1625  twin-arginine translocation pathway signal  39.61 
 
 		 521 aa  316  5e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.127338  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  38.18 
 
 		 523 aa  315  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  38.36 
 
 		 522 aa  310  5e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  36.43 
 
 		 531 aa  302  9e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  38.15 
 
 		 555 aa  290  6e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  34.56 
 
 		 587 aa  265  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  37.75 
 
 		 540 aa  264  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  35.77 
 
 		 541 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  35.52 
 
 		 540 aa  260  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  36.05 
 
 		 550 aa  259  8e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  37.83 
 
 		 523 aa  259  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  35.83 
 
 		 541 aa  256  8e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  34.29 
 
 		 576 aa  247  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  31.76 
 
 		 606 aa  239  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  31.76 
 
 		 617 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  30.77 
 
 		 674 aa  235  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  32.88 
 
 		 574 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  30.47 
 
 		 564 aa  228  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  31.95 
 
 		 583 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  33.06 
 
 		 532 aa  216  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  29.1 
 
 		 589 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  29.57 
 
 		 588 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  29.39 
 
 		 588 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  32.26 
 
 		 596 aa  208  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  29.39 
 
 		 588 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  29.21 
 
 		 588 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  29.22 
 
 		 585 aa  202  9e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  29.7 
 
 		 589 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  29.13 
 
 		 557 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  35.45 
 
 		 588 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  29.15 
 
 		 557 aa  195  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  35.16 
 
 		 588 aa  194  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  35.16 
 
 		 588 aa  193  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  28.36 
 
 		 589 aa  193  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08622  alkaline phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08710)  28.27 
 
 		 641 aa  193  8e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  29.13 
 
 		 582 aa  190  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3596  twin-arginine translocation pathway signal  29.7 
 
 		 587 aa  187  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000163132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0979  alkaline phosphatase  27.66 
 
 		 622 aa  187  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  33.72 
 
 		 590 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0959  alkaline phosphatase  28.6 
 
 		 589 aa  183  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  28.87 
 
 		 450 aa  183  8.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2404  alkaline phosphatase  30.54 
 
 		 566 aa  181  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  36.82 
 
 		 588 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  33.52 
 
 		 600 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3184  alkaline phosphatase  34.67 
 
 		 587 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5492  Alkaline phosphatase  28.52 
 
 		 575 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201843  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  33.44 
 
 		 679 aa  149  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  27.27 
 
 		 710 aa  147  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  28.61 
 
 		 670 aa  144  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1243  Alkaline phosphatase  25.1 
 
 		 714 aa  141  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0092  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  48.23 
 
 		 209 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1502  Alkaline phosphatase  27.35 
 
 		 545 aa  123  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3950  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.73 
 
 		 689 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.028055  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  27.06 
 
 		 513 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>