More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1820 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1820  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2103  two component transcriptional regulator  99.58 
 
 		 240 aa  490  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0666731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2160  two component transcriptional regulator  92.5 
 
 		 240 aa  463  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  51.88 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.46 
 
 		 231 aa  234  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0151  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 241 aa  221  9e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2014  two component transcriptional regulator  48.31 
 
 		 239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.48 
 
 		 240 aa  218  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  46.91 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 236 aa  208  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0275  two component transcriptional regulator  49.17 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0194  two component transcriptional regulator  49.38 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.58 
 
 		 234 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.58 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0213  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.96 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0395409  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2635  two component transcriptional regulator  48.13 
 
 		 239 aa  198  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.179803  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0328  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 235 aa  188  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  45.31 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  41.88 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  41.88 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 241 aa  186  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  41.45 
 
 		 235 aa  185  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  41.45 
 
 		 235 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  41.45 
 
 		 235 aa  185  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  41.45 
 
 		 235 aa  185  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  41.45 
 
 		 235 aa  185  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  41.45 
 
 		 235 aa  185  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  41.45 
 
 		 235 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  41.28 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  41.6 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  43.7 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  41.45 
 
 		 235 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.46 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.83 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.95 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  41.28 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  45.34 
 
 		 238 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.06 
 
 		 237 aa  183  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  41.28 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  41.28 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  42.74 
 
 		 236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.22 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  41.28 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  40.85 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.64 
 
 		 240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  40.85 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  45.42 
 
 		 232 aa  181  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  40.34 
 
 		 233 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  40.34 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  40.85 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  40.85 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.25 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  40.85 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.25 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.13 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1508  two component transcriptional regulator  40.42 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1010  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000199702  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  42.62 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  41.42 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  44.92 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0880  two component transcriptional regulator  44.02 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220279 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  42.62 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  42.62 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  40.85 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  42.19 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  41.84 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  40.85 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  40.85 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  42.62 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.19 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  42.19 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  42.19 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  42.19 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  42.19 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  42.19 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  42.19 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  42.19 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  42.19 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  42.8 
 
 		 243 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  42.19 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  42.68 
 
 		 240 aa  178  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  42.19 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  42.19 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  41.7 
 
 		 235 aa  178  4.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  42.19 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  40.08 
 
 		 251 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 242 aa  178  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>